Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hectd3Q3U487 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hectd3Q3U487 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hectd3Q3U487 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hectd3Q3U487 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hectd3Q3U487 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hectd3Q3U487 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hectd3Q3U487 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hectd3Q3U487 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hectd3Q3U487 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hectd3Q3U487 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hectd3Q3U487 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hectd3Q3U487 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hectd3Q3U487 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hectd3Q3U487 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hectd3Q3U487 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hectd3Q3U487 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hectd3Q3U487 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hectd3Q3U487 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hectd3Q3U487 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hectd3Q3U487 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hectd3Q3U487 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hectd3Q3U487 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hectd3Q3U487 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hectd3Q3U487 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hectd3Q3U487 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hectd3Q3U487 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hectd3Q3U487 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hectd3Q3U487 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hectd3Q3U487 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hectd3Q3U487 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hectd3Q3U487 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hectd3Q3U487 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hectd3Q3U487 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hectd3Q3U487 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hectd3Q3U487 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hectd3Q3U487 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hectd3Q3U487 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hectd3Q3U487 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hectd3Q3U487 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hectd3Q3U487 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hectd3Q3U487 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hectd3Q3U487 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hectd3Q3U487 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hectd3Q3U487 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hectd3Q3U487 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hectd3Q3U487 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hectd3Q3U487 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hectd3Q3U487 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hectd3Q3U487 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hectd3Q3U487 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hectd3Q3U487 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hectd3Q3U487 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hectd3Q3U487 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hectd3Q3U487 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hectd3Q3U487 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hectd3Q3U487 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hectd3Q3U487 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hectd3Q3U487 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hectd3Q3U487 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hectd3Q3U487 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hectd3Q3U487 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hectd3Q3U487 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hectd3Q3U487 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hectd3Q3U487 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hectd3Q3U487 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hectd3Q3U487 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hectd3Q3U487 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hectd3Q3U487 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hectd3Q3U487 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hectd3Q3U487 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hectd3Q3U487 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hectd3Q3U487 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hectd3Q3U487 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hectd3Q3U487 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hectd3Q3U487 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hectd3Q3U487 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hectd3Q3U487 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hectd3Q3U487 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hectd3Q3U487 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hectd3Q3U487 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hectd3Q3U487 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hectd3Q3U487 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hectd3Q3U487 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hectd3Q3U487 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hectd3Q3U487 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hectd3Q3U487 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hectd3Q3U487 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hectd3Q3U487 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hectd3Q3U487 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hectd3Q3U487 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hectd3Q3U487 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms