Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1Y4

Dennd4b, DENN domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dennd4bQ3U1Y4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,41■■■■■ 4,38
Dennd4bQ3U1Y4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42,38■■■■■ 4,37
Dennd4bQ3U1Y4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,33■■■■■ 4,37
Dennd4bQ3U1Y4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,28■■■■■ 4,36
Dennd4bQ3U1Y4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,26■■■■■ 4,36
Dennd4bQ3U1Y4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC42,24■■■■■ 4,35
Dennd4bQ3U1Y4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC42,24■■■■■ 4,35
Dennd4bQ3U1Y4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42,23■■■■■ 4,35
Dennd4bQ3U1Y4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC42,22■■■■■ 4,35
Dennd4bQ3U1Y4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC42,17■■■■■ 4,34
Dennd4bQ3U1Y4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,17■■■■■ 4,34
Dennd4bQ3U1Y4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,12■■■■■ 4,33
Dennd4bQ3U1Y4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,1■■■■■ 4,33
Dennd4bQ3U1Y4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC42,08■■■■■ 4,33
Dennd4bQ3U1Y4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,05■■■■■ 4,32
Dennd4bQ3U1Y4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,04■■■■■ 4,32
Dennd4bQ3U1Y4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42,03■■■■■ 4,32
Dennd4bQ3U1Y4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC41,98■■■■■ 4,31
Dennd4bQ3U1Y4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,98■■■■■ 4,31
Dennd4bQ3U1Y4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC41,93■■■■■ 4,3
Dennd4bQ3U1Y4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,92■■■■■ 4,3
Dennd4bQ3U1Y4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,9■■■■■ 4,3
Dennd4bQ3U1Y4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC41,89■■■■■ 4,3
Dennd4bQ3U1Y4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,88■■■■■ 4,29
Dennd4bQ3U1Y4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,74■■■■■ 4,27
Dennd4bQ3U1Y4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41,74■■■■■ 4,27
Dennd4bQ3U1Y4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,66■■■■■ 4,26
Dennd4bQ3U1Y4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC41,59■■■■■ 4,25
Dennd4bQ3U1Y4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,59■■■■■ 4,25
Dennd4bQ3U1Y4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,55■■■■■ 4,24
Dennd4bQ3U1Y4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,51■■■■■ 4,24
Dennd4bQ3U1Y4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC41,48■■■■■ 4,23
Dennd4bQ3U1Y4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,47■■■■■ 4,23
Dennd4bQ3U1Y4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC41,45■■■■■ 4,23
Dennd4bQ3U1Y4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,42■■■■■ 4,22
Dennd4bQ3U1Y4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC41,42■■■■■ 4,22
Dennd4bQ3U1Y4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,38■■■■■ 4,21
Dennd4bQ3U1Y4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,35■■■■■ 4,21
Dennd4bQ3U1Y4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC41,34■■■■■ 4,21
Dennd4bQ3U1Y4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,34■■■■■ 4,21
Dennd4bQ3U1Y4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC41,33■■■■■ 4,21
Dennd4bQ3U1Y4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,33■■■■■ 4,21
Dennd4bQ3U1Y4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41,31■■■■■ 4,2
Dennd4bQ3U1Y4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC41,27■■■■■ 4,2
Dennd4bQ3U1Y4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC41,24■■■■■ 4,19
Dennd4bQ3U1Y4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC41,24■■■■■ 4,19
Dennd4bQ3U1Y4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,22■■■■■ 4,19
Dennd4bQ3U1Y4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC41,2■■■■■ 4,19
Dennd4bQ3U1Y4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC41,18■■■■■ 4,18
Dennd4bQ3U1Y4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC41,1■■■■■ 4,17
Dennd4bQ3U1Y4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC41,09■■■■■ 4,17
Dennd4bQ3U1Y4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,09■■■■■ 4,17
Dennd4bQ3U1Y4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Dennd4bQ3U1Y4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,06■■■■■ 4,16
Dennd4bQ3U1Y4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC41,05■■■■■ 4,16
Dennd4bQ3U1Y4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC41,04■■■■■ 4,16
Dennd4bQ3U1Y4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC41,02■■■■■ 4,16
Dennd4bQ3U1Y4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC41,02■■■■■ 4,16
Dennd4bQ3U1Y4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,98■■■■■ 4,15
Dennd4bQ3U1Y4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,94■■■■■ 4,14
Dennd4bQ3U1Y4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,92■■■■■ 4,14
Dennd4bQ3U1Y4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
Dennd4bQ3U1Y4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,87■■■■■ 4,13
Dennd4bQ3U1Y4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,12
Dennd4bQ3U1Y4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,76■■■■■ 4,11
Dennd4bQ3U1Y4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,73■■■■■ 4,11
Dennd4bQ3U1Y4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC40,72■■■■■ 4,11
Dennd4bQ3U1Y4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40,71■■■■■ 4,11
Dennd4bQ3U1Y4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC40,7■■■■■ 4,11
Dennd4bQ3U1Y4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC40,68■■■■■ 4,1
Dennd4bQ3U1Y4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40,61■■■■■ 4,09
Dennd4bQ3U1Y4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC40,6■■■■■ 4,09
Dennd4bQ3U1Y4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,59■■■■■ 4,09
Dennd4bQ3U1Y4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,59■■■■■ 4,09
Dennd4bQ3U1Y4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Dennd4bQ3U1Y4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC40,5■■■■■ 4,07
Dennd4bQ3U1Y4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC40,5■■■■■ 4,07
Dennd4bQ3U1Y4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,49■■■■■ 4,07
Dennd4bQ3U1Y4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,48■■■■■ 4,07
Dennd4bQ3U1Y4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC40,47■■■■■ 4,07
Dennd4bQ3U1Y4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Dennd4bQ3U1Y4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC40,43■■■■■ 4,06
Dennd4bQ3U1Y4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Dennd4bQ3U1Y4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC40,42■■■■■ 4,06
Dennd4bQ3U1Y4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC40,41■■■■■ 4,06
Dennd4bQ3U1Y4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC40,4■■■■■ 4,06
Dennd4bQ3U1Y4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
Dennd4bQ3U1Y4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,35■■■■■ 4,05
Dennd4bQ3U1Y4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,34■■■■■ 4,05
Dennd4bQ3U1Y4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Dennd4bQ3U1Y4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Dennd4bQ3U1Y4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40,32■■■■■ 4,05
Dennd4bQ3U1Y4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC40,2■■■■■ 4,03
Dennd4bQ3U1Y4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,2■■■■■ 4,03
Dennd4bQ3U1Y4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,2■■■■■ 4,03
Dennd4bQ3U1Y4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,19■■■■■ 4,02
Dennd4bQ3U1Y4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Dennd4bQ3U1Y4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,14■■■■■ 4,02
Dennd4bQ3U1Y4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,13■■■■■ 4,02
Dennd4bQ3U1Y4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40,12■■■■■ 4,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms