Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Smim6Q3U0I6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Smim6Q3U0I6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Smim6Q3U0I6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
Smim6Q3U0I6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Smim6Q3U0I6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Smim6Q3U0I6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Smim6Q3U0I6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Smim6Q3U0I6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Smim6Q3U0I6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Smim6Q3U0I6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Smim6Q3U0I6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,14■□□□□ 0,97
Smim6Q3U0I6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,14■□□□□ 0,97
Smim6Q3U0I6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Smim6Q3U0I6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,08■□□□□ 0,97
Smim6Q3U0I6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Smim6Q3U0I6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Smim6Q3U0I6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21,05■□□□□ 0,96
Smim6Q3U0I6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21,03■□□□□ 0,96
Smim6Q3U0I6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Smim6Q3U0I6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Smim6Q3U0I6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Smim6Q3U0I6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Smim6Q3U0I6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Smim6Q3U0I6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Smim6Q3U0I6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20,96■□□□□ 0,95
Smim6Q3U0I6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Smim6Q3U0I6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Smim6Q3U0I6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Smim6Q3U0I6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Smim6Q3U0I6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Smim6Q3U0I6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Smim6Q3U0I6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Smim6Q3U0I6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20,88■□□□□ 0,93
Smim6Q3U0I6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Smim6Q3U0I6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Smim6Q3U0I6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Smim6Q3U0I6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20,82■□□□□ 0,92
Smim6Q3U0I6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Smim6Q3U0I6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Smim6Q3U0I6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20,78■□□□□ 0,92
Smim6Q3U0I6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Smim6Q3U0I6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Smim6Q3U0I6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Smim6Q3U0I6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Smim6Q3U0I6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Smim6Q3U0I6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Smim6Q3U0I6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Smim6Q3U0I6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Smim6Q3U0I6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Smim6Q3U0I6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Smim6Q3U0I6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Smim6Q3U0I6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Smim6Q3U0I6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Smim6Q3U0I6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Smim6Q3U0I6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Smim6Q3U0I6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Smim6Q3U0I6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Smim6Q3U0I6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Smim6Q3U0I6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Smim6Q3U0I6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Smim6Q3U0I6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Smim6Q3U0I6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Smim6Q3U0I6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Smim6Q3U0I6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Smim6Q3U0I6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Smim6Q3U0I6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,87
Smim6Q3U0I6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Smim6Q3U0I6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Smim6Q3U0I6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Smim6Q3U0I6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Smim6Q3U0I6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20,48■□□□□ 0,87
Smim6Q3U0I6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20,47■□□□□ 0,87
Smim6Q3U0I6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Smim6Q3U0I6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Smim6Q3U0I6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Smim6Q3U0I6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Smim6Q3U0I6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Smim6Q3U0I6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Smim6Q3U0I6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Smim6Q3U0I6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Smim6Q3U0I6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Smim6Q3U0I6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Smim6Q3U0I6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Smim6Q3U0I6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,38■□□□□ 0,85
Smim6Q3U0I6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Smim6Q3U0I6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Smim6Q3U0I6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Smim6Q3U0I6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Smim6Q3U0I6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Smim6Q3U0I6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Smim6Q3U0I6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Smim6Q3U0I6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Smim6Q3U0I6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Smim6Q3U0I6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20,34■□□□□ 0,85
Smim6Q3U0I6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,84
Smim6Q3U0I6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20,32■□□□□ 0,84
Smim6Q3U0I6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20,32■□□□□ 0,84
Smim6Q3U0I6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Smim6Q3U0I6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms