Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccndbp1Q3TVC7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccndbp1Q3TVC7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccndbp1Q3TVC7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccndbp1Q3TVC7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccndbp1Q3TVC7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccndbp1Q3TVC7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccndbp1Q3TVC7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccndbp1Q3TVC7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccndbp1Q3TVC7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccndbp1Q3TVC7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccndbp1Q3TVC7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccndbp1Q3TVC7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccndbp1Q3TVC7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccndbp1Q3TVC7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccndbp1Q3TVC7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccndbp1Q3TVC7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccndbp1Q3TVC7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccndbp1Q3TVC7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccndbp1Q3TVC7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccndbp1Q3TVC7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccndbp1Q3TVC7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccndbp1Q3TVC7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccndbp1Q3TVC7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccndbp1Q3TVC7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccndbp1Q3TVC7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccndbp1Q3TVC7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccndbp1Q3TVC7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccndbp1Q3TVC7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccndbp1Q3TVC7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccndbp1Q3TVC7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccndbp1Q3TVC7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccndbp1Q3TVC7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccndbp1Q3TVC7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccndbp1Q3TVC7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccndbp1Q3TVC7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccndbp1Q3TVC7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccndbp1Q3TVC7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccndbp1Q3TVC7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccndbp1Q3TVC7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccndbp1Q3TVC7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccndbp1Q3TVC7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccndbp1Q3TVC7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccndbp1Q3TVC7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccndbp1Q3TVC7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccndbp1Q3TVC7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccndbp1Q3TVC7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccndbp1Q3TVC7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccndbp1Q3TVC7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccndbp1Q3TVC7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccndbp1Q3TVC7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccndbp1Q3TVC7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccndbp1Q3TVC7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccndbp1Q3TVC7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccndbp1Q3TVC7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 271.3 ms