Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Cers3Q1A3B0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cers3Q1A3B0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cers3Q1A3B0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cers3Q1A3B0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Cers3Q1A3B0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cers3Q1A3B0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cers3Q1A3B0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cers3Q1A3B0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cers3Q1A3B0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cers3Q1A3B0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cers3Q1A3B0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cers3Q1A3B0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Cers3Q1A3B0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Cers3Q1A3B0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cers3Q1A3B0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cers3Q1A3B0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cers3Q1A3B0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Cers3Q1A3B0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cers3Q1A3B0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cers3Q1A3B0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cers3Q1A3B0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cers3Q1A3B0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cers3Q1A3B0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cers3Q1A3B0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cers3Q1A3B0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cers3Q1A3B0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Cers3Q1A3B0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cers3Q1A3B0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cers3Q1A3B0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Cers3Q1A3B0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cers3Q1A3B0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cers3Q1A3B0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cers3Q1A3B0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cers3Q1A3B0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cers3Q1A3B0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Cers3Q1A3B0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cers3Q1A3B0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cers3Q1A3B0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cers3Q1A3B0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Cers3Q1A3B0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cers3Q1A3B0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cers3Q1A3B0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cers3Q1A3B0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cers3Q1A3B0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cers3Q1A3B0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cers3Q1A3B0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cers3Q1A3B0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cers3Q1A3B0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cers3Q1A3B0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cers3Q1A3B0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cers3Q1A3B0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cers3Q1A3B0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cers3Q1A3B0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cers3Q1A3B0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Cers3Q1A3B0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cers3Q1A3B0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cers3Q1A3B0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cers3Q1A3B0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cers3Q1A3B0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cers3Q1A3B0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cers3Q1A3B0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cers3Q1A3B0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cers3Q1A3B0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cers3Q1A3B0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Cers3Q1A3B0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cers3Q1A3B0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Cers3Q1A3B0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cers3Q1A3B0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cers3Q1A3B0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cers3Q1A3B0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cers3Q1A3B0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cers3Q1A3B0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cers3Q1A3B0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cers3Q1A3B0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cers3Q1A3B0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cers3Q1A3B0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cers3Q1A3B0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cers3Q1A3B0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cers3Q1A3B0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cers3Q1A3B0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cers3Q1A3B0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cers3Q1A3B0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Cers3Q1A3B0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cers3Q1A3B0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cers3Q1A3B0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cers3Q1A3B0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Cers3Q1A3B0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Cers3Q1A3B0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cers3Q1A3B0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cers3Q1A3B0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cers3Q1A3B0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cers3Q1A3B0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cers3Q1A3B0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Cers3Q1A3B0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cers3Q1A3B0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Cers3Q1A3B0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cers3Q1A3B0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cers3Q1A3B0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cers3Q1A3B0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
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