Protein–RNA interactions for Protein: Q14A28

Prok1, Prokineticin-1, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok1Q14A28 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prok1Q14A28 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prok1Q14A28 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prok1Q14A28 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prok1Q14A28 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prok1Q14A28 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prok1Q14A28 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prok1Q14A28 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prok1Q14A28 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prok1Q14A28 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prok1Q14A28 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prok1Q14A28 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prok1Q14A28 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prok1Q14A28 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prok1Q14A28 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prok1Q14A28 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prok1Q14A28 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prok1Q14A28 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prok1Q14A28 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prok1Q14A28 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prok1Q14A28 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prok1Q14A28 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prok1Q14A28 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prok1Q14A28 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prok1Q14A28 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prok1Q14A28 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prok1Q14A28 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prok1Q14A28 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prok1Q14A28 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prok1Q14A28 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prok1Q14A28 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prok1Q14A28 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prok1Q14A28 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prok1Q14A28 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prok1Q14A28 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prok1Q14A28 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prok1Q14A28 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prok1Q14A28 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prok1Q14A28 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prok1Q14A28 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prok1Q14A28 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prok1Q14A28 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prok1Q14A28 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prok1Q14A28 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prok1Q14A28 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prok1Q14A28 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prok1Q14A28 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prok1Q14A28 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prok1Q14A28 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prok1Q14A28 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prok1Q14A28 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prok1Q14A28 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prok1Q14A28 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prok1Q14A28 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prok1Q14A28 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prok1Q14A28 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prok1Q14A28 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prok1Q14A28 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prok1Q14A28 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prok1Q14A28 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prok1Q14A28 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prok1Q14A28 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prok1Q14A28 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prok1Q14A28 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prok1Q14A28 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prok1Q14A28 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prok1Q14A28 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prok1Q14A28 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prok1Q14A28 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prok1Q14A28 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prok1Q14A28 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prok1Q14A28 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prok1Q14A28 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prok1Q14A28 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prok1Q14A28 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prok1Q14A28 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prok1Q14A28 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prok1Q14A28 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prok1Q14A28 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prok1Q14A28 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prok1Q14A28 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prok1Q14A28 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prok1Q14A28 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prok1Q14A28 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prok1Q14A28 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prok1Q14A28 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prok1Q14A28 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prok1Q14A28 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prok1Q14A28 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prok1Q14A28 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prok1Q14A28 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prok1Q14A28 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prok1Q14A28 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prok1Q14A28 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prok1Q14A28 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prok1Q14A28 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prok1Q14A28 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prok1Q14A28 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prok1Q14A28 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prok1Q14A28 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms