Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Ccdc162pQ0VG85 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Ccdc162pQ0VG85 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Ccdc162pQ0VG85 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Ccdc162pQ0VG85 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Ccdc162pQ0VG85 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Ccdc162pQ0VG85 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Ccdc162pQ0VG85 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Ccdc162pQ0VG85 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Ccdc162pQ0VG85 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Ccdc162pQ0VG85 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,7■■■□□ 2,5
Ccdc162pQ0VG85 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Ccdc162pQ0VG85 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Ccdc162pQ0VG85 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Ccdc162pQ0VG85 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Ccdc162pQ0VG85 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Ccdc162pQ0VG85 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,55■■■□□ 2,48
Ccdc162pQ0VG85 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Ccdc162pQ0VG85 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Ccdc162pQ0VG85 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Ccdc162pQ0VG85 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Ccdc162pQ0VG85 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30,37■■■□□ 2,45
Ccdc162pQ0VG85 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30,37■■■□□ 2,45
Ccdc162pQ0VG85 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,35■■■□□ 2,45
Ccdc162pQ0VG85 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Ccdc162pQ0VG85 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Ccdc162pQ0VG85 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Ccdc162pQ0VG85 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Ccdc162pQ0VG85 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Ccdc162pQ0VG85 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Ccdc162pQ0VG85 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Ccdc162pQ0VG85 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ccdc162pQ0VG85 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Ccdc162pQ0VG85 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30,1■■■□□ 2,41
Ccdc162pQ0VG85 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Ccdc162pQ0VG85 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ccdc162pQ0VG85 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ccdc162pQ0VG85 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Ccdc162pQ0VG85 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Ccdc162pQ0VG85 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
Ccdc162pQ0VG85 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ccdc162pQ0VG85 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ccdc162pQ0VG85 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ccdc162pQ0VG85 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ccdc162pQ0VG85 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ccdc162pQ0VG85 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Ccdc162pQ0VG85 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Ccdc162pQ0VG85 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ccdc162pQ0VG85 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ccdc162pQ0VG85 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ccdc162pQ0VG85 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,89■■■□□ 2,38
Ccdc162pQ0VG85 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ccdc162pQ0VG85 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ccdc162pQ0VG85 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ccdc162pQ0VG85 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ccdc162pQ0VG85 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ccdc162pQ0VG85 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ccdc162pQ0VG85 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ccdc162pQ0VG85 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Ccdc162pQ0VG85 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Ccdc162pQ0VG85 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Ccdc162pQ0VG85 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Ccdc162pQ0VG85 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Ccdc162pQ0VG85 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ccdc162pQ0VG85 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ccdc162pQ0VG85 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
Ccdc162pQ0VG85 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ccdc162pQ0VG85 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ccdc162pQ0VG85 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ccdc162pQ0VG85 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ccdc162pQ0VG85 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
Ccdc162pQ0VG85 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Ccdc162pQ0VG85 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Ccdc162pQ0VG85 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Ccdc162pQ0VG85 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Ccdc162pQ0VG85 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Ccdc162pQ0VG85 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Ccdc162pQ0VG85 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Ccdc162pQ0VG85 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Ccdc162pQ0VG85 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ccdc162pQ0VG85 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ccdc162pQ0VG85 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
Ccdc162pQ0VG85 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ccdc162pQ0VG85 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,48■■■□□ 2,31
Ccdc162pQ0VG85 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Ccdc162pQ0VG85 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ccdc162pQ0VG85 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ccdc162pQ0VG85 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ccdc162pQ0VG85 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ccdc162pQ0VG85 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Ccdc162pQ0VG85 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ccdc162pQ0VG85 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ccdc162pQ0VG85 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Ccdc162pQ0VG85 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Ccdc162pQ0VG85 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ccdc162pQ0VG85 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms