Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Cntnap5bQ0V8T8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Cntnap5bQ0V8T8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Cntnap5bQ0V8T8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Cntnap5bQ0V8T8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Cntnap5bQ0V8T8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Cntnap5bQ0V8T8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Cntnap5bQ0V8T8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
Cntnap5bQ0V8T8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Cntnap5bQ0V8T8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31,44■■■□□ 2,62
Cntnap5bQ0V8T8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Cntnap5bQ0V8T8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31,39■■■□□ 2,62
Cntnap5bQ0V8T8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Cntnap5bQ0V8T8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Cntnap5bQ0V8T8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Cntnap5bQ0V8T8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Cntnap5bQ0V8T8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Cntnap5bQ0V8T8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Cntnap5bQ0V8T8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Cntnap5bQ0V8T8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Cntnap5bQ0V8T8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,26■■■□□ 2,6
Cntnap5bQ0V8T8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Cntnap5bQ0V8T8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31,2■■■□□ 2,58
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31,14■■■□□ 2,58
Cntnap5bQ0V8T8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,13■■■□□ 2,57
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,11■■■□□ 2,57
Cntnap5bQ0V8T8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Cntnap5bQ0V8T8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31,05■■■□□ 2,56
Cntnap5bQ0V8T8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Cntnap5bQ0V8T8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Cntnap5bQ0V8T8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Cntnap5bQ0V8T8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Cntnap5bQ0V8T8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Cntnap5bQ0V8T8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,97■■■□□ 2,55
Cntnap5bQ0V8T8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Cntnap5bQ0V8T8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Cntnap5bQ0V8T8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Cntnap5bQ0V8T8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Cntnap5bQ0V8T8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Cntnap5bQ0V8T8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Cntnap5bQ0V8T8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Cntnap5bQ0V8T8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,82■■■□□ 2,52
Cntnap5bQ0V8T8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Cntnap5bQ0V8T8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Cntnap5bQ0V8T8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Cntnap5bQ0V8T8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Cntnap5bQ0V8T8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Cntnap5bQ0V8T8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Cntnap5bQ0V8T8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Cntnap5bQ0V8T8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Cntnap5bQ0V8T8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
Cntnap5bQ0V8T8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Cntnap5bQ0V8T8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Cntnap5bQ0V8T8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Cntnap5bQ0V8T8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30,53■■■□□ 2,48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Cntnap5bQ0V8T8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Cntnap5bQ0V8T8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Cntnap5bQ0V8T8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Cntnap5bQ0V8T8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Cntnap5bQ0V8T8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Cntnap5bQ0V8T8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Cntnap5bQ0V8T8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Cntnap5bQ0V8T8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Cntnap5bQ0V8T8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Cntnap5bQ0V8T8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Cntnap5bQ0V8T8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Cntnap5bQ0V8T8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Cntnap5bQ0V8T8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30,31■■■□□ 2,44
Cntnap5bQ0V8T8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Cntnap5bQ0V8T8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Cntnap5bQ0V8T8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Cntnap5bQ0V8T8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30,29■■■□□ 2,44
Cntnap5bQ0V8T8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Cntnap5bQ0V8T8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Cntnap5bQ0V8T8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Cntnap5bQ0V8T8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Cntnap5bQ0V8T8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Cntnap5bQ0V8T8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Cntnap5bQ0V8T8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Cntnap5bQ0V8T8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Cntnap5bQ0V8T8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Cntnap5bQ0V8T8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms