Protein–RNA interactions for Protein: Q0GNC1

Inf2, Inverted formin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Inf2Q0GNC1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Inf2Q0GNC1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Inf2Q0GNC1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Inf2Q0GNC1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Inf2Q0GNC1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Inf2Q0GNC1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Inf2Q0GNC1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Inf2Q0GNC1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Inf2Q0GNC1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Inf2Q0GNC1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Inf2Q0GNC1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Inf2Q0GNC1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Inf2Q0GNC1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Inf2Q0GNC1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Inf2Q0GNC1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Inf2Q0GNC1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Inf2Q0GNC1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Inf2Q0GNC1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Inf2Q0GNC1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Inf2Q0GNC1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Inf2Q0GNC1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Inf2Q0GNC1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Inf2Q0GNC1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Inf2Q0GNC1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Inf2Q0GNC1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Inf2Q0GNC1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Inf2Q0GNC1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Inf2Q0GNC1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Inf2Q0GNC1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Inf2Q0GNC1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Inf2Q0GNC1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Inf2Q0GNC1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Inf2Q0GNC1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Inf2Q0GNC1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Inf2Q0GNC1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Inf2Q0GNC1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Inf2Q0GNC1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Inf2Q0GNC1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Inf2Q0GNC1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Inf2Q0GNC1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Inf2Q0GNC1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Inf2Q0GNC1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Inf2Q0GNC1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Inf2Q0GNC1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Inf2Q0GNC1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Inf2Q0GNC1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Inf2Q0GNC1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Inf2Q0GNC1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Inf2Q0GNC1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Inf2Q0GNC1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Inf2Q0GNC1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Inf2Q0GNC1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Inf2Q0GNC1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Inf2Q0GNC1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Inf2Q0GNC1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Inf2Q0GNC1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Inf2Q0GNC1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Inf2Q0GNC1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Inf2Q0GNC1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Inf2Q0GNC1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Inf2Q0GNC1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Inf2Q0GNC1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Inf2Q0GNC1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Inf2Q0GNC1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Inf2Q0GNC1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Inf2Q0GNC1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Inf2Q0GNC1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Inf2Q0GNC1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Inf2Q0GNC1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Inf2Q0GNC1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Inf2Q0GNC1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Inf2Q0GNC1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Inf2Q0GNC1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Inf2Q0GNC1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Inf2Q0GNC1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Inf2Q0GNC1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Inf2Q0GNC1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Inf2Q0GNC1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Inf2Q0GNC1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Inf2Q0GNC1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Inf2Q0GNC1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Inf2Q0GNC1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Inf2Q0GNC1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Inf2Q0GNC1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Inf2Q0GNC1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Inf2Q0GNC1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Inf2Q0GNC1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Inf2Q0GNC1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Inf2Q0GNC1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Inf2Q0GNC1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Inf2Q0GNC1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Inf2Q0GNC1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Inf2Q0GNC1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Inf2Q0GNC1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Inf2Q0GNC1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Inf2Q0GNC1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Inf2Q0GNC1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Inf2Q0GNC1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Inf2Q0GNC1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Inf2Q0GNC1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms