Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnn2Q08093 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cnn2Q08093 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnn2Q08093 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnn2Q08093 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnn2Q08093 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnn2Q08093 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnn2Q08093 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnn2Q08093 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnn2Q08093 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnn2Q08093 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnn2Q08093 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnn2Q08093 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnn2Q08093 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnn2Q08093 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnn2Q08093 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnn2Q08093 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnn2Q08093 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnn2Q08093 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnn2Q08093 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cnn2Q08093 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnn2Q08093 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnn2Q08093 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnn2Q08093 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnn2Q08093 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnn2Q08093 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnn2Q08093 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnn2Q08093 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnn2Q08093 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnn2Q08093 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnn2Q08093 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnn2Q08093 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnn2Q08093 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnn2Q08093 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cnn2Q08093 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnn2Q08093 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnn2Q08093 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnn2Q08093 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnn2Q08093 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnn2Q08093 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnn2Q08093 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnn2Q08093 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnn2Q08093 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnn2Q08093 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnn2Q08093 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnn2Q08093 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnn2Q08093 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnn2Q08093 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnn2Q08093 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnn2Q08093 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnn2Q08093 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnn2Q08093 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnn2Q08093 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnn2Q08093 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnn2Q08093 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnn2Q08093 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnn2Q08093 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnn2Q08093 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnn2Q08093 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnn2Q08093 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnn2Q08093 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnn2Q08093 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnn2Q08093 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnn2Q08093 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnn2Q08093 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnn2Q08093 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnn2Q08093 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnn2Q08093 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnn2Q08093 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Cnn2Q08093 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnn2Q08093 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnn2Q08093 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnn2Q08093 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnn2Q08093 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnn2Q08093 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnn2Q08093 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnn2Q08093 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnn2Q08093 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnn2Q08093 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnn2Q08093 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnn2Q08093 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnn2Q08093 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnn2Q08093 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnn2Q08093 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnn2Q08093 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnn2Q08093 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnn2Q08093 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnn2Q08093 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnn2Q08093 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnn2Q08093 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnn2Q08093 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnn2Q08093 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnn2Q08093 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnn2Q08093 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnn2Q08093 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnn2Q08093 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnn2Q08093 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnn2Q08093 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnn2Q08093 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnn2Q08093 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms