Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cntn3Q07409 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cntn3Q07409 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cntn3Q07409 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cntn3Q07409 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cntn3Q07409 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cntn3Q07409 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cntn3Q07409 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cntn3Q07409 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cntn3Q07409 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cntn3Q07409 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cntn3Q07409 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cntn3Q07409 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cntn3Q07409 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cntn3Q07409 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cntn3Q07409 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cntn3Q07409 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cntn3Q07409 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cntn3Q07409 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cntn3Q07409 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cntn3Q07409 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cntn3Q07409 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cntn3Q07409 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cntn3Q07409 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cntn3Q07409 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cntn3Q07409 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cntn3Q07409 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cntn3Q07409 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cntn3Q07409 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cntn3Q07409 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cntn3Q07409 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cntn3Q07409 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cntn3Q07409 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cntn3Q07409 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cntn3Q07409 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cntn3Q07409 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cntn3Q07409 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cntn3Q07409 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cntn3Q07409 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cntn3Q07409 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cntn3Q07409 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cntn3Q07409 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cntn3Q07409 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cntn3Q07409 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cntn3Q07409 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cntn3Q07409 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cntn3Q07409 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cntn3Q07409 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cntn3Q07409 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cntn3Q07409 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cntn3Q07409 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cntn3Q07409 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cntn3Q07409 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cntn3Q07409 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cntn3Q07409 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cntn3Q07409 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cntn3Q07409 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cntn3Q07409 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cntn3Q07409 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Cntn3Q07409 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cntn3Q07409 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cntn3Q07409 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cntn3Q07409 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cntn3Q07409 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cntn3Q07409 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cntn3Q07409 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cntn3Q07409 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cntn3Q07409 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cntn3Q07409 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cntn3Q07409 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cntn3Q07409 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cntn3Q07409 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cntn3Q07409 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cntn3Q07409 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cntn3Q07409 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cntn3Q07409 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cntn3Q07409 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cntn3Q07409 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cntn3Q07409 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cntn3Q07409 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cntn3Q07409 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cntn3Q07409 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cntn3Q07409 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cntn3Q07409 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cntn3Q07409 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cntn3Q07409 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cntn3Q07409 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cntn3Q07409 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cntn3Q07409 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cntn3Q07409 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cntn3Q07409 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cntn3Q07409 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cntn3Q07409 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cntn3Q07409 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cntn3Q07409 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cntn3Q07409 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cntn3Q07409 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cntn3Q07409 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cntn3Q07409 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cntn3Q07409 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms