Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gdf9Q07105 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gdf9Q07105 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gdf9Q07105 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gdf9Q07105 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gdf9Q07105 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gdf9Q07105 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gdf9Q07105 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gdf9Q07105 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gdf9Q07105 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gdf9Q07105 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gdf9Q07105 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gdf9Q07105 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gdf9Q07105 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gdf9Q07105 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gdf9Q07105 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Gdf9Q07105 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gdf9Q07105 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gdf9Q07105 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gdf9Q07105 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gdf9Q07105 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gdf9Q07105 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gdf9Q07105 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gdf9Q07105 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gdf9Q07105 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gdf9Q07105 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gdf9Q07105 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gdf9Q07105 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gdf9Q07105 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gdf9Q07105 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Gdf9Q07105 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gdf9Q07105 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gdf9Q07105 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gdf9Q07105 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gdf9Q07105 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gdf9Q07105 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gdf9Q07105 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Gdf9Q07105 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gdf9Q07105 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gdf9Q07105 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gdf9Q07105 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gdf9Q07105 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gdf9Q07105 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gdf9Q07105 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gdf9Q07105 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gdf9Q07105 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gdf9Q07105 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gdf9Q07105 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gdf9Q07105 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gdf9Q07105 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gdf9Q07105 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gdf9Q07105 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gdf9Q07105 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gdf9Q07105 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gdf9Q07105 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gdf9Q07105 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gdf9Q07105 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gdf9Q07105 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gdf9Q07105 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gdf9Q07105 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gdf9Q07105 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gdf9Q07105 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gdf9Q07105 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gdf9Q07105 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gdf9Q07105 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gdf9Q07105 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gdf9Q07105 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gdf9Q07105 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gdf9Q07105 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gdf9Q07105 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gdf9Q07105 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gdf9Q07105 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gdf9Q07105 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gdf9Q07105 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gdf9Q07105 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gdf9Q07105 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gdf9Q07105 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gdf9Q07105 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gdf9Q07105 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Gdf9Q07105 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gdf9Q07105 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Gdf9Q07105 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gdf9Q07105 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gdf9Q07105 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gdf9Q07105 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gdf9Q07105 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gdf9Q07105 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gdf9Q07105 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gdf9Q07105 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gdf9Q07105 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gdf9Q07105 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gdf9Q07105 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gdf9Q07105 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gdf9Q07105 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gdf9Q07105 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gdf9Q07105 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gdf9Q07105 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gdf9Q07105 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gdf9Q07105 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gdf9Q07105 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 273.8 ms