Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Thbs2Q03350 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Thbs2Q03350 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Thbs2Q03350 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Thbs2Q03350 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Thbs2Q03350 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
Thbs2Q03350 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Thbs2Q03350 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
Thbs2Q03350 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,33■■□□□ 1,49
Thbs2Q03350 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,33■■□□□ 1,49
Thbs2Q03350 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,31■■□□□ 1,48
Thbs2Q03350 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Thbs2Q03350 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Thbs2Q03350 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Thbs2Q03350 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Thbs2Q03350 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Thbs2Q03350 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Thbs2Q03350 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Thbs2Q03350 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,21■■□□□ 1,47
Thbs2Q03350 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Thbs2Q03350 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Thbs2Q03350 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Thbs2Q03350 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Thbs2Q03350 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Thbs2Q03350 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Thbs2Q03350 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Thbs2Q03350 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Thbs2Q03350 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Thbs2Q03350 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Thbs2Q03350 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Thbs2Q03350 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Thbs2Q03350 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Thbs2Q03350 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,93■■□□□ 1,42
Thbs2Q03350 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Thbs2Q03350 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Thbs2Q03350 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Thbs2Q03350 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,89■■□□□ 1,41
Thbs2Q03350 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Thbs2Q03350 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23,84■■□□□ 1,41
Thbs2Q03350 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Thbs2Q03350 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Thbs2Q03350 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Thbs2Q03350 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Thbs2Q03350 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Thbs2Q03350 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Thbs2Q03350 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Thbs2Q03350 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Thbs2Q03350 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Thbs2Q03350 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Thbs2Q03350 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Thbs2Q03350 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Thbs2Q03350 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,64■■□□□ 1,37
Thbs2Q03350 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Thbs2Q03350 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Thbs2Q03350 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Thbs2Q03350 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,62■■□□□ 1,37
Thbs2Q03350 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Thbs2Q03350 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Thbs2Q03350 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Thbs2Q03350 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Thbs2Q03350 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Thbs2Q03350 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,36
Thbs2Q03350 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Thbs2Q03350 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Thbs2Q03350 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Thbs2Q03350 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Thbs2Q03350 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Thbs2Q03350 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
Thbs2Q03350 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Thbs2Q03350 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Thbs2Q03350 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Thbs2Q03350 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Thbs2Q03350 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Thbs2Q03350 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23,46■■□□□ 1,35
Thbs2Q03350 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Thbs2Q03350 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Thbs2Q03350 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Thbs2Q03350 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Thbs2Q03350 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Thbs2Q03350 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Thbs2Q03350 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Thbs2Q03350 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Thbs2Q03350 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Thbs2Q03350 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Thbs2Q03350 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Thbs2Q03350 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,33■■□□□ 1,33
Thbs2Q03350 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Thbs2Q03350 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Thbs2Q03350 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Thbs2Q03350 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Thbs2Q03350 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
Thbs2Q03350 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Thbs2Q03350 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23,27■■□□□ 1,32
Thbs2Q03350 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Thbs2Q03350 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Thbs2Q03350 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Thbs2Q03350 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Thbs2Q03350 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Thbs2Q03350 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Thbs2Q03350 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,4 ms