Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Rbp1Q00915 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rbp1Q00915 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Rbp1Q00915 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,93
Rbp1Q00915 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Rbp1Q00915 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Rbp1Q00915 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Rbp1Q00915 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Rbp1Q00915 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,95■■□□□ 1,91
Rbp1Q00915 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Rbp1Q00915 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Rbp1Q00915 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Rbp1Q00915 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Rbp1Q00915 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Rbp1Q00915 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Rbp1Q00915 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
Rbp1Q00915 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Rbp1Q00915 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Rbp1Q00915 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Rbp1Q00915 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Rbp1Q00915 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Rbp1Q00915 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Rbp1Q00915 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Rbp1Q00915 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Rbp1Q00915 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Rbp1Q00915 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Rbp1Q00915 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Rbp1Q00915 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Rbp1Q00915 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,61■■□□□ 1,85
Rbp1Q00915 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Rbp1Q00915 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Rbp1Q00915 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Rbp1Q00915 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Rbp1Q00915 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Rbp1Q00915 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Rbp1Q00915 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Rbp1Q00915 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Rbp1Q00915 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Rbp1Q00915 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Rbp1Q00915 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Rbp1Q00915 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Rbp1Q00915 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Rbp1Q00915 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Rbp1Q00915 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Rbp1Q00915 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Rbp1Q00915 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Rbp1Q00915 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Rbp1Q00915 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Rbp1Q00915 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Rbp1Q00915 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Rbp1Q00915 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Rbp1Q00915 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Rbp1Q00915 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Rbp1Q00915 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Rbp1Q00915 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Rbp1Q00915 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Rbp1Q00915 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Rbp1Q00915 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Rbp1Q00915 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Rbp1Q00915 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Rbp1Q00915 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Rbp1Q00915 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Rbp1Q00915 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Rbp1Q00915 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Rbp1Q00915 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,22■■□□□ 1,79
Rbp1Q00915 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Rbp1Q00915 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Rbp1Q00915 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Rbp1Q00915 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Rbp1Q00915 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Rbp1Q00915 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Rbp1Q00915 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Rbp1Q00915 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Rbp1Q00915 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Rbp1Q00915 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Rbp1Q00915 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Rbp1Q00915 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Rbp1Q00915 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Rbp1Q00915 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Rbp1Q00915 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Rbp1Q00915 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Rbp1Q00915 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Rbp1Q00915 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rbp1Q00915 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rbp1Q00915 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rbp1Q00915 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,91■■□□□ 1,74
Rbp1Q00915 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Rbp1Q00915 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Rbp1Q00915 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,89■■□□□ 1,74
Rbp1Q00915 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Rbp1Q00915 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Rbp1Q00915 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rbp1Q00915 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Rbp1Q00915 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rbp1Q00915 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
Rbp1Q00915 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Rbp1Q00915 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Rbp1Q00915 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Rbp1Q00915 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Rbp1Q00915 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67,5 ms