Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn1bP97952 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn1bP97952 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scn1bP97952 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scn1bP97952 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn1bP97952 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn1bP97952 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn1bP97952 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scn1bP97952 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn1bP97952 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn1bP97952 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn1bP97952 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn1bP97952 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn1bP97952 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn1bP97952 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn1bP97952 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scn1bP97952 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn1bP97952 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn1bP97952 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn1bP97952 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn1bP97952 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn1bP97952 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn1bP97952 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn1bP97952 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn1bP97952 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn1bP97952 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scn1bP97952 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn1bP97952 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scn1bP97952 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn1bP97952 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scn1bP97952 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn1bP97952 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn1bP97952 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scn1bP97952 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn1bP97952 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn1bP97952 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn1bP97952 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn1bP97952 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn1bP97952 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn1bP97952 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn1bP97952 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn1bP97952 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn1bP97952 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn1bP97952 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn1bP97952 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn1bP97952 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn1bP97952 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn1bP97952 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn1bP97952 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn1bP97952 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn1bP97952 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn1bP97952 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn1bP97952 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn1bP97952 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn1bP97952 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn1bP97952 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn1bP97952 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn1bP97952 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn1bP97952 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn1bP97952 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn1bP97952 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn1bP97952 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn1bP97952 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn1bP97952 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn1bP97952 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn1bP97952 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn1bP97952 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn1bP97952 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn1bP97952 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn1bP97952 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn1bP97952 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scn1bP97952 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn1bP97952 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scn1bP97952 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn1bP97952 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn1bP97952 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Scn1bP97952 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn1bP97952 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn1bP97952 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn1bP97952 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn1bP97952 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn1bP97952 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn1bP97952 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn1bP97952 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn1bP97952 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn1bP97952 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn1bP97952 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn1bP97952 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn1bP97952 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn1bP97952 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn1bP97952 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn1bP97952 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn1bP97952 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn1bP97952 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn1bP97952 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn1bP97952 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn1bP97952 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn1bP97952 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn1bP97952 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn1bP97952 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms