Protein–RNA interactions for Protein: P97817

Cdr2, Cerebellar degeneration-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2P97817 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdr2P97817 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdr2P97817 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdr2P97817 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdr2P97817 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdr2P97817 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdr2P97817 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cdr2P97817 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdr2P97817 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdr2P97817 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdr2P97817 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdr2P97817 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdr2P97817 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdr2P97817 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdr2P97817 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cdr2P97817 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdr2P97817 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdr2P97817 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdr2P97817 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdr2P97817 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdr2P97817 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdr2P97817 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdr2P97817 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdr2P97817 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdr2P97817 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdr2P97817 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdr2P97817 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdr2P97817 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdr2P97817 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdr2P97817 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdr2P97817 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cdr2P97817 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdr2P97817 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdr2P97817 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdr2P97817 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdr2P97817 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdr2P97817 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdr2P97817 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdr2P97817 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdr2P97817 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdr2P97817 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdr2P97817 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdr2P97817 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdr2P97817 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdr2P97817 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdr2P97817 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdr2P97817 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdr2P97817 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdr2P97817 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdr2P97817 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdr2P97817 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdr2P97817 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdr2P97817 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdr2P97817 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdr2P97817 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdr2P97817 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdr2P97817 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdr2P97817 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdr2P97817 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdr2P97817 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdr2P97817 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdr2P97817 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdr2P97817 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdr2P97817 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdr2P97817 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdr2P97817 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdr2P97817 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdr2P97817 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdr2P97817 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdr2P97817 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdr2P97817 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdr2P97817 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdr2P97817 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdr2P97817 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdr2P97817 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdr2P97817 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdr2P97817 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdr2P97817 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdr2P97817 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdr2P97817 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdr2P97817 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdr2P97817 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdr2P97817 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdr2P97817 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdr2P97817 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdr2P97817 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdr2P97817 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdr2P97817 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdr2P97817 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cdr2P97817 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdr2P97817 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdr2P97817 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdr2P97817 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdr2P97817 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdr2P97817 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdr2P97817 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdr2P97817 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdr2P97817 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdr2P97817 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdr2P97817 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms