Protein–RNA interactions for Protein: P97503

Nkx3-2, Homeobox protein Nkx-3.2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-2P97503 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx3-2P97503 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx3-2P97503 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx3-2P97503 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nkx3-2P97503 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx3-2P97503 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx3-2P97503 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx3-2P97503 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx3-2P97503 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx3-2P97503 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx3-2P97503 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx3-2P97503 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx3-2P97503 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nkx3-2P97503 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nkx3-2P97503 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx3-2P97503 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nkx3-2P97503 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nkx3-2P97503 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nkx3-2P97503 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nkx3-2P97503 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx3-2P97503 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nkx3-2P97503 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx3-2P97503 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nkx3-2P97503 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx3-2P97503 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx3-2P97503 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx3-2P97503 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx3-2P97503 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx3-2P97503 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx3-2P97503 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx3-2P97503 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx3-2P97503 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx3-2P97503 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx3-2P97503 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nkx3-2P97503 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx3-2P97503 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nkx3-2P97503 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nkx3-2P97503 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nkx3-2P97503 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx3-2P97503 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx3-2P97503 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx3-2P97503 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx3-2P97503 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx3-2P97503 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx3-2P97503 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx3-2P97503 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx3-2P97503 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx3-2P97503 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx3-2P97503 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx3-2P97503 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx3-2P97503 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx3-2P97503 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx3-2P97503 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx3-2P97503 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx3-2P97503 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx3-2P97503 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx3-2P97503 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nkx3-2P97503 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx3-2P97503 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx3-2P97503 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx3-2P97503 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx3-2P97503 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx3-2P97503 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nkx3-2P97503 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx3-2P97503 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx3-2P97503 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nkx3-2P97503 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nkx3-2P97503 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx3-2P97503 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx3-2P97503 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx3-2P97503 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nkx3-2P97503 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx3-2P97503 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx3-2P97503 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx3-2P97503 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx3-2P97503 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx3-2P97503 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx3-2P97503 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx3-2P97503 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx3-2P97503 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx3-2P97503 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx3-2P97503 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx3-2P97503 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx3-2P97503 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx3-2P97503 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx3-2P97503 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx3-2P97503 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx3-2P97503 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx3-2P97503 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx3-2P97503 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx3-2P97503 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx3-2P97503 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nkx3-2P97503 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx3-2P97503 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx3-2P97503 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx3-2P97503 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx3-2P97503 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx3-2P97503 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx3-2P97503 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nkx3-2P97503 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms