Protein–RNA interactions for Protein: P97454

Smad5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad5P97454 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smad5P97454 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Smad5P97454 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smad5P97454 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smad5P97454 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smad5P97454 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smad5P97454 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smad5P97454 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smad5P97454 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Smad5P97454 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smad5P97454 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smad5P97454 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smad5P97454 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smad5P97454 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smad5P97454 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smad5P97454 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smad5P97454 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smad5P97454 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Smad5P97454 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smad5P97454 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smad5P97454 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smad5P97454 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smad5P97454 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smad5P97454 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Smad5P97454 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Smad5P97454 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smad5P97454 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smad5P97454 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smad5P97454 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smad5P97454 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smad5P97454 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smad5P97454 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smad5P97454 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smad5P97454 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smad5P97454 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smad5P97454 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad5P97454 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smad5P97454 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smad5P97454 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smad5P97454 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smad5P97454 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smad5P97454 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smad5P97454 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smad5P97454 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smad5P97454 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smad5P97454 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smad5P97454 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smad5P97454 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smad5P97454 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smad5P97454 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smad5P97454 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smad5P97454 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smad5P97454 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smad5P97454 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smad5P97454 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smad5P97454 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smad5P97454 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Smad5P97454 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smad5P97454 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smad5P97454 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smad5P97454 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smad5P97454 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smad5P97454 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smad5P97454 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smad5P97454 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smad5P97454 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smad5P97454 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smad5P97454 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smad5P97454 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smad5P97454 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smad5P97454 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smad5P97454 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smad5P97454 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smad5P97454 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad5P97454 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smad5P97454 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smad5P97454 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smad5P97454 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smad5P97454 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smad5P97454 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smad5P97454 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smad5P97454 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smad5P97454 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smad5P97454 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smad5P97454 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smad5P97454 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smad5P97454 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smad5P97454 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smad5P97454 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smad5P97454 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smad5P97454 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smad5P97454 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smad5P97454 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smad5P97454 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smad5P97454 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smad5P97454 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad5P97454 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smad5P97454 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smad5P97454 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad5P97454 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms