Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Nkx2-3P97334 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Nkx2-3P97334 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Nkx2-3P97334 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Nkx2-3P97334 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Nkx2-3P97334 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Nkx2-3P97334 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Nkx2-3P97334 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Nkx2-3P97334 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Nkx2-3P97334 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Nkx2-3P97334 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Nkx2-3P97334 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Nkx2-3P97334 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Nkx2-3P97334 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Nkx2-3P97334 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Nkx2-3P97334 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Nkx2-3P97334 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Nkx2-3P97334 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Nkx2-3P97334 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Nkx2-3P97334 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Nkx2-3P97334 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Nkx2-3P97334 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Nkx2-3P97334 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Nkx2-3P97334 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Nkx2-3P97334 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Nkx2-3P97334 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Nkx2-3P97334 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Nkx2-3P97334 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Nkx2-3P97334 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Nkx2-3P97334 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Nkx2-3P97334 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Nkx2-3P97334 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Nkx2-3P97334 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Nkx2-3P97334 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Nkx2-3P97334 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Nkx2-3P97334 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Nkx2-3P97334 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Nkx2-3P97334 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Nkx2-3P97334 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Nkx2-3P97334 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Nkx2-3P97334 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Nkx2-3P97334 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Nkx2-3P97334 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Nkx2-3P97334 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Nkx2-3P97334 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Nkx2-3P97334 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Nkx2-3P97334 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Nkx2-3P97334 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Nkx2-3P97334 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Nkx2-3P97334 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Nkx2-3P97334 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Nkx2-3P97334 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Nkx2-3P97334 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Nkx2-3P97334 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Nkx2-3P97334 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Nkx2-3P97334 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Nkx2-3P97334 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Nkx2-3P97334 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Nkx2-3P97334 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Nkx2-3P97334 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Nkx2-3P97334 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Nkx2-3P97334 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Nkx2-3P97334 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Nkx2-3P97334 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Nkx2-3P97334 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Nkx2-3P97334 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Nkx2-3P97334 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Nkx2-3P97334 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Nkx2-3P97334 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Nkx2-3P97334 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Nkx2-3P97334 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Nkx2-3P97334 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Nkx2-3P97334 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Nkx2-3P97334 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Nkx2-3P97334 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Nkx2-3P97334 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Nkx2-3P97334 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Nkx2-3P97334 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Nkx2-3P97334 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Nkx2-3P97334 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Nkx2-3P97334 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Nkx2-3P97334 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Nkx2-3P97334 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Nkx2-3P97334 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Nkx2-3P97334 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
Nkx2-3P97334 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Nkx2-3P97334 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Nkx2-3P97334 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Nkx2-3P97334 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Nkx2-3P97334 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Nkx2-3P97334 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Nkx2-3P97334 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Nkx2-3P97334 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Nkx2-3P97334 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Nkx2-3P97334 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Nkx2-3P97334 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Nkx2-3P97334 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Nkx2-3P97334 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Nkx2-3P97334 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Nkx2-3P97334 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms