Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36,5■■■■□ 3,43
Nkx2-3P97334 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36,49■■■■□ 3,43
Nkx2-3P97334 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,47■■■■□ 3,43
Nkx2-3P97334 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Nkx2-3P97334 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36,43■■■■□ 3,42
Nkx2-3P97334 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Nkx2-3P97334 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Nkx2-3P97334 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Nkx2-3P97334 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Nkx2-3P97334 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Nkx2-3P97334 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Nkx2-3P97334 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,11■■■■□ 3,37
Nkx2-3P97334 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Nkx2-3P97334 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Nkx2-3P97334 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,37
Nkx2-3P97334 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36,06■■■■□ 3,36
Nkx2-3P97334 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36,04■■■■□ 3,36
Nkx2-3P97334 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35,96■■■■□ 3,35
Nkx2-3P97334 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Nkx2-3P97334 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,91■■■■□ 3,34
Nkx2-3P97334 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Nkx2-3P97334 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Nkx2-3P97334 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Nkx2-3P97334 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Nkx2-3P97334 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
Nkx2-3P97334 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35,79■■■■□ 3,32
Nkx2-3P97334 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Nkx2-3P97334 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Nkx2-3P97334 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Nkx2-3P97334 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Nkx2-3P97334 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Nkx2-3P97334 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,58■■■■□ 3,29
Nkx2-3P97334 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35,57■■■■□ 3,28
Nkx2-3P97334 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35,57■■■■□ 3,28
Nkx2-3P97334 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Nkx2-3P97334 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Nkx2-3P97334 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Nkx2-3P97334 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Nkx2-3P97334 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35,45■■■■□ 3,27
Nkx2-3P97334 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Nkx2-3P97334 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35,41■■■■□ 3,26
Nkx2-3P97334 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Nkx2-3P97334 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35,38■■■■□ 3,25
Nkx2-3P97334 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Nkx2-3P97334 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Nkx2-3P97334 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Nkx2-3P97334 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35,31■■■■□ 3,24
Nkx2-3P97334 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35,29■■■■□ 3,24
Nkx2-3P97334 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Nkx2-3P97334 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Nkx2-3P97334 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Nkx2-3P97334 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Nkx2-3P97334 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Nkx2-3P97334 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35,17■■■■□ 3,22
Nkx2-3P97334 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Nkx2-3P97334 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Nkx2-3P97334 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35,13■■■■□ 3,21
Nkx2-3P97334 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Nkx2-3P97334 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,12■■■■□ 3,21
Nkx2-3P97334 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Nkx2-3P97334 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Nkx2-3P97334 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Nkx2-3P97334 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Nkx2-3P97334 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Nkx2-3P97334 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Nkx2-3P97334 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,98■■■■□ 3,19
Nkx2-3P97334 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Nkx2-3P97334 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Nkx2-3P97334 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,9■■■■□ 3,18
Nkx2-3P97334 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Nkx2-3P97334 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Nkx2-3P97334 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34,78■■■■□ 3,16
Nkx2-3P97334 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,78■■■■□ 3,16
Nkx2-3P97334 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,77■■■■□ 3,16
Nkx2-3P97334 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Nkx2-3P97334 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,73■■■■□ 3,15
Nkx2-3P97334 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,7■■■■□ 3,14
Nkx2-3P97334 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Nkx2-3P97334 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Nkx2-3P97334 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Nkx2-3P97334 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Nkx2-3P97334 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,6■■■■□ 3,13
Nkx2-3P97334 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,59■■■■□ 3,13
Nkx2-3P97334 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Nkx2-3P97334 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34,57■■■■□ 3,13
Nkx2-3P97334 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Nkx2-3P97334 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34,55■■■■□ 3,12
Nkx2-3P97334 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Nkx2-3P97334 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Nkx2-3P97334 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Nkx2-3P97334 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Nkx2-3P97334 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34,49■■■■□ 3,11
Nkx2-3P97334 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Nkx2-3P97334 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34,46■■■■□ 3,11
Nkx2-3P97334 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Nkx2-3P97334 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34,42■■■■□ 3,1
Nkx2-3P97334 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Nkx2-3P97334 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Nkx2-3P97334 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Nkx2-3P97334 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,9 ms