Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Nrp1P97333 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nrp1P97333 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Nrp1P97333 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nrp1P97333 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nrp1P97333 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Nrp1P97333 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nrp1P97333 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nrp1P97333 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nrp1P97333 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Nrp1P97333 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nrp1P97333 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nrp1P97333 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nrp1P97333 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nrp1P97333 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nrp1P97333 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nrp1P97333 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Nrp1P97333 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nrp1P97333 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nrp1P97333 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nrp1P97333 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nrp1P97333 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nrp1P97333 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nrp1P97333 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nrp1P97333 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nrp1P97333 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nrp1P97333 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nrp1P97333 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nrp1P97333 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nrp1P97333 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nrp1P97333 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Nrp1P97333 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nrp1P97333 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nrp1P97333 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nrp1P97333 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nrp1P97333 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nrp1P97333 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nrp1P97333 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nrp1P97333 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nrp1P97333 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nrp1P97333 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nrp1P97333 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nrp1P97333 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nrp1P97333 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nrp1P97333 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nrp1P97333 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nrp1P97333 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Nrp1P97333 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nrp1P97333 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nrp1P97333 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nrp1P97333 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nrp1P97333 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Nrp1P97333 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nrp1P97333 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nrp1P97333 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nrp1P97333 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nrp1P97333 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nrp1P97333 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nrp1P97333 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nrp1P97333 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nrp1P97333 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nrp1P97333 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nrp1P97333 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nrp1P97333 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nrp1P97333 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nrp1P97333 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nrp1P97333 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrp1P97333 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrp1P97333 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nrp1P97333 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nrp1P97333 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nrp1P97333 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nrp1P97333 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nrp1P97333 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nrp1P97333 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nrp1P97333 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nrp1P97333 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Nrp1P97333 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nrp1P97333 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nrp1P97333 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Nrp1P97333 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nrp1P97333 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nrp1P97333 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nrp1P97333 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nrp1P97333 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nrp1P97333 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nrp1P97333 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nrp1P97333 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nrp1P97333 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nrp1P97333 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nrp1P97333 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nrp1P97333 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nrp1P97333 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nrp1P97333 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Nrp1P97333 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nrp1P97333 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nrp1P97333 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nrp1P97333 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Nrp1P97333 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Nrp1P97333 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms