Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Nucb2P81117 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Nucb2P81117 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Nucb2P81117 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Nucb2P81117 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Nucb2P81117 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Nucb2P81117 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Nucb2P81117 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Nucb2P81117 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30,13■■■□□ 2,41
Nucb2P81117 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Nucb2P81117 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Nucb2P81117 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Nucb2P81117 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Nucb2P81117 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Nucb2P81117 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Nucb2P81117 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Nucb2P81117 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Nucb2P81117 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Nucb2P81117 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Nucb2P81117 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Nucb2P81117 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
Nucb2P81117 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Nucb2P81117 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Nucb2P81117 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Nucb2P81117 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Nucb2P81117 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Nucb2P81117 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Nucb2P81117 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Nucb2P81117 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Nucb2P81117 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Nucb2P81117 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Nucb2P81117 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Nucb2P81117 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Nucb2P81117 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Nucb2P81117 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Nucb2P81117 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Nucb2P81117 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Nucb2P81117 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Nucb2P81117 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Nucb2P81117 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,51■■■□□ 2,31
Nucb2P81117 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Nucb2P81117 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Nucb2P81117 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Nucb2P81117 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Nucb2P81117 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Nucb2P81117 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Nucb2P81117 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Nucb2P81117 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Nucb2P81117 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Nucb2P81117 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Nucb2P81117 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Nucb2P81117 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Nucb2P81117 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Nucb2P81117 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Nucb2P81117 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Nucb2P81117 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Nucb2P81117 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Nucb2P81117 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Nucb2P81117 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Nucb2P81117 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Nucb2P81117 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Nucb2P81117 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Nucb2P81117 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Nucb2P81117 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Nucb2P81117 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Nucb2P81117 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Nucb2P81117 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,26■■■□□ 2,28
Nucb2P81117 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Nucb2P81117 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Nucb2P81117 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Nucb2P81117 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Nucb2P81117 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Nucb2P81117 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Nucb2P81117 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Nucb2P81117 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Nucb2P81117 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Nucb2P81117 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Nucb2P81117 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Nucb2P81117 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Nucb2P81117 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Nucb2P81117 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Nucb2P81117 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Nucb2P81117 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Nucb2P81117 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Nucb2P81117 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Nucb2P81117 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Nucb2P81117 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Nucb2P81117 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Nucb2P81117 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Nucb2P81117 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Nucb2P81117 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Nucb2P81117 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Nucb2P81117 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Nucb2P81117 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Nucb2P81117 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Nucb2P81117 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Nucb2P81117 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Nucb2P81117 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Nucb2P81117 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Nucb2P81117 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,9 ms