Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Irx3P81067 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Irx3P81067 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Irx3P81067 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Irx3P81067 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Irx3P81067 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Irx3P81067 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Irx3P81067 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Irx3P81067 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Irx3P81067 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Irx3P81067 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Irx3P81067 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Irx3P81067 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Irx3P81067 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Irx3P81067 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Irx3P81067 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Irx3P81067 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Irx3P81067 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Irx3P81067 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Irx3P81067 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Irx3P81067 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Irx3P81067 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Irx3P81067 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Irx3P81067 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Irx3P81067 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Irx3P81067 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Irx3P81067 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Irx3P81067 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Irx3P81067 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Irx3P81067 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Irx3P81067 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Irx3P81067 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Irx3P81067 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Irx3P81067 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Irx3P81067 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Irx3P81067 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Irx3P81067 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Irx3P81067 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Irx3P81067 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Irx3P81067 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Irx3P81067 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Irx3P81067 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Irx3P81067 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Irx3P81067 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Irx3P81067 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Irx3P81067 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Irx3P81067 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Irx3P81067 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Irx3P81067 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Irx3P81067 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Irx3P81067 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Irx3P81067 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Irx3P81067 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Irx3P81067 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Irx3P81067 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
Irx3P81067 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Irx3P81067 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Irx3P81067 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Irx3P81067 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Irx3P81067 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Irx3P81067 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Irx3P81067 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Irx3P81067 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Irx3P81067 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Irx3P81067 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Irx3P81067 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Irx3P81067 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Irx3P81067 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Irx3P81067 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Irx3P81067 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Irx3P81067 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
Irx3P81067 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Irx3P81067 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Irx3P81067 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Irx3P81067 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Irx3P81067 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Irx3P81067 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Irx3P81067 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Irx3P81067 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Irx3P81067 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Irx3P81067 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Irx3P81067 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Irx3P81067 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Irx3P81067 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Irx3P81067 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Irx3P81067 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Irx3P81067 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Irx3P81067 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Irx3P81067 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Irx3P81067 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Irx3P81067 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Irx3P81067 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Irx3P81067 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Irx3P81067 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Irx3P81067 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Irx3P81067 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Irx3P81067 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Irx3P81067 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Irx3P81067 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Irx3P81067 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms