Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Irx2P81066 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Irx2P81066 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,48■■■□□ 2,15
Irx2P81066 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Irx2P81066 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Irx2P81066 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Irx2P81066 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Irx2P81066 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Irx2P81066 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Irx2P81066 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Irx2P81066 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Irx2P81066 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Irx2P81066 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Irx2P81066 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Irx2P81066 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
Irx2P81066 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Irx2P81066 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Irx2P81066 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Irx2P81066 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Irx2P81066 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,08
Irx2P81066 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Irx2P81066 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Irx2P81066 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Irx2P81066 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Irx2P81066 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Irx2P81066 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Irx2P81066 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Irx2P81066 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Irx2P81066 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Irx2P81066 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Irx2P81066 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Irx2P81066 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Irx2P81066 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Irx2P81066 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Irx2P81066 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,76■■■□□ 2,03
Irx2P81066 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Irx2P81066 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Irx2P81066 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Irx2P81066 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Irx2P81066 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Irx2P81066 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Irx2P81066 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Irx2P81066 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Irx2P81066 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Irx2P81066 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Irx2P81066 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Irx2P81066 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Irx2P81066 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,01
Irx2P81066 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Irx2P81066 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Irx2P81066 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Irx2P81066 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Irx2P81066 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Irx2P81066 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Irx2P81066 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,55■■■□□ 2
Irx2P81066 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,54■■■□□ 2
Irx2P81066 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Irx2P81066 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Irx2P81066 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Irx2P81066 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Irx2P81066 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Irx2P81066 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Irx2P81066 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Irx2P81066 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Irx2P81066 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Irx2P81066 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Irx2P81066 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Irx2P81066 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Irx2P81066 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Irx2P81066 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Irx2P81066 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Irx2P81066 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Irx2P81066 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Irx2P81066 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Irx2P81066 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Irx2P81066 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Irx2P81066 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Irx2P81066 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Irx2P81066 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Irx2P81066 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Irx2P81066 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Irx2P81066 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Irx2P81066 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Irx2P81066 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Irx2P81066 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Irx2P81066 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Irx2P81066 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Irx2P81066 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Irx2P81066 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Irx2P81066 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Irx2P81066 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,95
Irx2P81066 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Irx2P81066 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Irx2P81066 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Irx2P81066 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Irx2P81066 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Irx2P81066 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Irx2P81066 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Irx2P81066 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Irx2P81066 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,13■■□□□ 1,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,8 ms