Protein–RNA interactions for Protein: P70677

Casp3, Caspase-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp3P70677 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Casp3P70677 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Casp3P70677 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casp3P70677 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Casp3P70677 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Casp3P70677 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casp3P70677 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Casp3P70677 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Casp3P70677 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Casp3P70677 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Casp3P70677 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Casp3P70677 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp3P70677 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Casp3P70677 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Casp3P70677 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Casp3P70677 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Casp3P70677 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casp3P70677 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Casp3P70677 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Casp3P70677 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Casp3P70677 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Casp3P70677 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Casp3P70677 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casp3P70677 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Casp3P70677 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Casp3P70677 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Casp3P70677 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Casp3P70677 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Casp3P70677 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Casp3P70677 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Casp3P70677 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Casp3P70677 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casp3P70677 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casp3P70677 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casp3P70677 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Casp3P70677 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casp3P70677 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casp3P70677 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casp3P70677 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casp3P70677 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Casp3P70677 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casp3P70677 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casp3P70677 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casp3P70677 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Casp3P70677 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casp3P70677 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Casp3P70677 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casp3P70677 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Casp3P70677 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casp3P70677 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Casp3P70677 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casp3P70677 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casp3P70677 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Casp3P70677 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casp3P70677 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Casp3P70677 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casp3P70677 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Casp3P70677 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Casp3P70677 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casp3P70677 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Casp3P70677 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casp3P70677 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casp3P70677 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Casp3P70677 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Casp3P70677 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp3P70677 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp3P70677 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp3P70677 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casp3P70677 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp3P70677 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casp3P70677 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp3P70677 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casp3P70677 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Casp3P70677 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp3P70677 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casp3P70677 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp3P70677 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casp3P70677 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp3P70677 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp3P70677 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp3P70677 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp3P70677 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp3P70677 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp3P70677 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp3P70677 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp3P70677 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Casp3P70677 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp3P70677 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp3P70677 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp3P70677 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp3P70677 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp3P70677 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp3P70677 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp3P70677 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp3P70677 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp3P70677 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp3P70677 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp3P70677 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp3P70677 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp3P70677 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms