Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ldb1P70662 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ldb1P70662 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ldb1P70662 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ldb1P70662 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ldb1P70662 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ldb1P70662 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ldb1P70662 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ldb1P70662 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ldb1P70662 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ldb1P70662 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ldb1P70662 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ldb1P70662 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ldb1P70662 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ldb1P70662 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ldb1P70662 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ldb1P70662 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ldb1P70662 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ldb1P70662 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ldb1P70662 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ldb1P70662 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ldb1P70662 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ldb1P70662 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ldb1P70662 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ldb1P70662 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ldb1P70662 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ldb1P70662 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ldb1P70662 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ldb1P70662 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ldb1P70662 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ldb1P70662 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ldb1P70662 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ldb1P70662 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ldb1P70662 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ldb1P70662 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ldb1P70662 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ldb1P70662 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ldb1P70662 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ldb1P70662 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ldb1P70662 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ldb1P70662 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ldb1P70662 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ldb1P70662 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ldb1P70662 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ldb1P70662 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ldb1P70662 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ldb1P70662 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ldb1P70662 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ldb1P70662 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ldb1P70662 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ldb1P70662 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ldb1P70662 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ldb1P70662 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ldb1P70662 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ldb1P70662 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ldb1P70662 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ldb1P70662 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ldb1P70662 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ldb1P70662 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ldb1P70662 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ldb1P70662 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ldb1P70662 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ldb1P70662 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ldb1P70662 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ldb1P70662 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ldb1P70662 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ldb1P70662 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ldb1P70662 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ldb1P70662 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ldb1P70662 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ldb1P70662 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ldb1P70662 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ldb1P70662 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ldb1P70662 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ldb1P70662 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ldb1P70662 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ldb1P70662 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ldb1P70662 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ldb1P70662 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ldb1P70662 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ldb1P70662 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ldb1P70662 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ldb1P70662 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ldb1P70662 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ldb1P70662 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ldb1P70662 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ldb1P70662 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ldb1P70662 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ldb1P70662 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ldb1P70662 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ldb1P70662 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ldb1P70662 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ldb1P70662 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ldb1P70662 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ldb1P70662 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ldb1P70662 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ldb1P70662 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ldb1P70662 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ldb1P70662 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ldb1P70662 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms