Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Hoxb13P70321 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Hoxb13P70321 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Hoxb13P70321 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,53
Hoxb13P70321 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
Hoxb13P70321 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Hoxb13P70321 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Hoxb13P70321 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Hoxb13P70321 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Hoxb13P70321 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Hoxb13P70321 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Hoxb13P70321 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Hoxb13P70321 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Hoxb13P70321 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Hoxb13P70321 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,49■■■□□ 2,47
Hoxb13P70321 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Hoxb13P70321 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Hoxb13P70321 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Hoxb13P70321 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Hoxb13P70321 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Hoxb13P70321 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Hoxb13P70321 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Hoxb13P70321 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Hoxb13P70321 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Hoxb13P70321 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Hoxb13P70321 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
Hoxb13P70321 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Hoxb13P70321 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Hoxb13P70321 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Hoxb13P70321 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Hoxb13P70321 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Hoxb13P70321 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Hoxb13P70321 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Hoxb13P70321 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Hoxb13P70321 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Hoxb13P70321 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Hoxb13P70321 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Hoxb13P70321 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Hoxb13P70321 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Hoxb13P70321 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Hoxb13P70321 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Hoxb13P70321 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Hoxb13P70321 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
Hoxb13P70321 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Hoxb13P70321 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
Hoxb13P70321 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Hoxb13P70321 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Hoxb13P70321 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Hoxb13P70321 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Hoxb13P70321 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,78■■■□□ 2,36
Hoxb13P70321 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Hoxb13P70321 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Hoxb13P70321 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Hoxb13P70321 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Hoxb13P70321 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Hoxb13P70321 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Hoxb13P70321 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Hoxb13P70321 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Hoxb13P70321 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Hoxb13P70321 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Hoxb13P70321 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Hoxb13P70321 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Hoxb13P70321 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Hoxb13P70321 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Hoxb13P70321 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Hoxb13P70321 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Hoxb13P70321 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
Hoxb13P70321 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Hoxb13P70321 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Hoxb13P70321 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Hoxb13P70321 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,45■■■□□ 2,31
Hoxb13P70321 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Hoxb13P70321 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Hoxb13P70321 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Hoxb13P70321 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Hoxb13P70321 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Hoxb13P70321 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Hoxb13P70321 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Hoxb13P70321 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Hoxb13P70321 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Hoxb13P70321 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Hoxb13P70321 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Hoxb13P70321 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Hoxb13P70321 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Hoxb13P70321 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Hoxb13P70321 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Hoxb13P70321 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Hoxb13P70321 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Hoxb13P70321 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Hoxb13P70321 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Hoxb13P70321 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Hoxb13P70321 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Hoxb13P70321 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Hoxb13P70321 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Hoxb13P70321 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
Hoxb13P70321 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Hoxb13P70321 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Hoxb13P70321 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Hoxb13P70321 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Hoxb13P70321 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms