Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,65■■■■□ 3,62
Stra8P70278 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
Stra8P70278 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,61
Stra8P70278 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Stra8P70278 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,52■■■■□ 3,6
Stra8P70278 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37,5■■■■□ 3,59
Stra8P70278 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Stra8P70278 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Stra8P70278 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,42■■■■□ 3,58
Stra8P70278 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37,36■■■■□ 3,57
Stra8P70278 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37,34■■■■□ 3,57
Stra8P70278 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Stra8P70278 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
Stra8P70278 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
Stra8P70278 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Stra8P70278 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Stra8P70278 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37,27■■■■□ 3,56
Stra8P70278 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Stra8P70278 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
Stra8P70278 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Stra8P70278 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Stra8P70278 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,53
Stra8P70278 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37,05■■■■□ 3,52
Stra8P70278 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
Stra8P70278 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Stra8P70278 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,97■■■■□ 3,51
Stra8P70278 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36,94■■■■□ 3,5
Stra8P70278 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36,92■■■■□ 3,5
Stra8P70278 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36,92■■■■□ 3,5
Stra8P70278 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Stra8P70278 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,5
Stra8P70278 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,48
Stra8P70278 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
Stra8P70278 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Stra8P70278 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36,75■■■■□ 3,47
Stra8P70278 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,7■■■■□ 3,46
Stra8P70278 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36,69■■■■□ 3,46
Stra8P70278 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Stra8P70278 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36,66■■■■□ 3,46
Stra8P70278 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36,64■■■■□ 3,46
Stra8P70278 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36,62■■■■□ 3,45
Stra8P70278 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36,6■■■■□ 3,45
Stra8P70278 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36,58■■■■□ 3,45
Stra8P70278 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,44
Stra8P70278 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,44
Stra8P70278 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Stra8P70278 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36,46■■■■□ 3,43
Stra8P70278 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Stra8P70278 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36,45■■■■□ 3,43
Stra8P70278 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Stra8P70278 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Stra8P70278 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Stra8P70278 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,35■■■■□ 3,41
Stra8P70278 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Stra8P70278 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Stra8P70278 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36,33■■■■□ 3,41
Stra8P70278 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Stra8P70278 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Stra8P70278 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Stra8P70278 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Stra8P70278 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Stra8P70278 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36,26■■■■□ 3,39
Stra8P70278 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Stra8P70278 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,38
Stra8P70278 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36,19■■■■□ 3,38
Stra8P70278 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Stra8P70278 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,16■■■■□ 3,38
Stra8P70278 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Stra8P70278 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36,12■■■■□ 3,37
Stra8P70278 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Stra8P70278 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Stra8P70278 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Stra8P70278 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Stra8P70278 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36,06■■■■□ 3,36
Stra8P70278 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Stra8P70278 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Stra8P70278 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Stra8P70278 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Stra8P70278 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Stra8P70278 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,89■■■■□ 3,34
Stra8P70278 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Stra8P70278 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Stra8P70278 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Stra8P70278 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35,84■■■■□ 3,33
Stra8P70278 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Stra8P70278 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Stra8P70278 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Stra8P70278 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,79■■■■□ 3,32
Stra8P70278 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Stra8P70278 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Stra8P70278 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Stra8P70278 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Stra8P70278 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Stra8P70278 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Stra8P70278 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35,73■■■■□ 3,31
Stra8P70278 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,73■■■■□ 3,31
Stra8P70278 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,73■■■■□ 3,31
Stra8P70278 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Stra8P70278 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Stra8P70278 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms