Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Pkn1P70268 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Pkn1P70268 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Pkn1P70268 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Pkn1P70268 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Pkn1P70268 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Pkn1P70268 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Pkn1P70268 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Pkn1P70268 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Pkn1P70268 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Pkn1P70268 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Pkn1P70268 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Pkn1P70268 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Pkn1P70268 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Pkn1P70268 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Pkn1P70268 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Pkn1P70268 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Pkn1P70268 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Pkn1P70268 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
Pkn1P70268 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Pkn1P70268 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Pkn1P70268 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,89■■■□□ 2,37
Pkn1P70268 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Pkn1P70268 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Pkn1P70268 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Pkn1P70268 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Pkn1P70268 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Pkn1P70268 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Pkn1P70268 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Pkn1P70268 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Pkn1P70268 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Pkn1P70268 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Pkn1P70268 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Pkn1P70268 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Pkn1P70268 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Pkn1P70268 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Pkn1P70268 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Pkn1P70268 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Pkn1P70268 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Pkn1P70268 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Pkn1P70268 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Pkn1P70268 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Pkn1P70268 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Pkn1P70268 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Pkn1P70268 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Pkn1P70268 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Pkn1P70268 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Pkn1P70268 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Pkn1P70268 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Pkn1P70268 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Pkn1P70268 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Pkn1P70268 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Pkn1P70268 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
Pkn1P70268 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Pkn1P70268 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Pkn1P70268 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Pkn1P70268 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Pkn1P70268 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Pkn1P70268 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,2■■■□□ 2,26
Pkn1P70268 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Pkn1P70268 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
Pkn1P70268 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Pkn1P70268 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Pkn1P70268 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Pkn1P70268 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Pkn1P70268 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Pkn1P70268 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Pkn1P70268 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,01■■■□□ 2,24
Pkn1P70268 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Pkn1P70268 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Pkn1P70268 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Pkn1P70268 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Pkn1P70268 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Pkn1P70268 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Pkn1P70268 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Pkn1P70268 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Pkn1P70268 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Pkn1P70268 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Pkn1P70268 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Pkn1P70268 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Pkn1P70268 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Pkn1P70268 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Pkn1P70268 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Pkn1P70268 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Pkn1P70268 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Pkn1P70268 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Pkn1P70268 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Pkn1P70268 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Pkn1P70268 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Pkn1P70268 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Pkn1P70268 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Pkn1P70268 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Pkn1P70268 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Pkn1P70268 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Pkn1P70268 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Pkn1P70268 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Pkn1P70268 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Pkn1P70268 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Pkn1P70268 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Pkn1P70268 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,56■■■□□ 2,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms