Protein–RNA interactions for Protein: P63268

Actg2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg2P63268 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actg2P63268 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Actg2P63268 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actg2P63268 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Actg2P63268 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actg2P63268 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actg2P63268 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actg2P63268 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actg2P63268 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actg2P63268 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actg2P63268 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actg2P63268 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actg2P63268 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actg2P63268 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Actg2P63268 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actg2P63268 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actg2P63268 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Actg2P63268 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Actg2P63268 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actg2P63268 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actg2P63268 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actg2P63268 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actg2P63268 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actg2P63268 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Actg2P63268 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actg2P63268 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actg2P63268 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Actg2P63268 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Actg2P63268 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Actg2P63268 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Actg2P63268 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Actg2P63268 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actg2P63268 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actg2P63268 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actg2P63268 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Actg2P63268 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Actg2P63268 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actg2P63268 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actg2P63268 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Actg2P63268 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Actg2P63268 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actg2P63268 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actg2P63268 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actg2P63268 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actg2P63268 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actg2P63268 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actg2P63268 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actg2P63268 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actg2P63268 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actg2P63268 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Actg2P63268 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actg2P63268 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actg2P63268 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actg2P63268 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Actg2P63268 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actg2P63268 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actg2P63268 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actg2P63268 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Actg2P63268 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Actg2P63268 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Actg2P63268 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Actg2P63268 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Actg2P63268 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actg2P63268 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Actg2P63268 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Actg2P63268 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actg2P63268 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actg2P63268 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actg2P63268 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actg2P63268 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actg2P63268 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actg2P63268 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actg2P63268 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actg2P63268 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actg2P63268 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actg2P63268 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Actg2P63268 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actg2P63268 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actg2P63268 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actg2P63268 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actg2P63268 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actg2P63268 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actg2P63268 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actg2P63268 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actg2P63268 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Actg2P63268 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actg2P63268 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actg2P63268 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actg2P63268 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actg2P63268 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actg2P63268 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actg2P63268 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actg2P63268 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actg2P63268 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actg2P63268 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actg2P63268 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actg2P63268 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actg2P63268 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actg2P63268 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actg2P63268 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms