Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Lsm5P62322 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Lsm5P62322 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Lsm5P62322 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Lsm5P62322 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Lsm5P62322 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,62■■□□□ 1,21
Lsm5P62322 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,6■■□□□ 1,21
Lsm5P62322 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Lsm5P62322 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,57■■□□□ 1,2
Lsm5P62322 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Lsm5P62322 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Lsm5P62322 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Lsm5P62322 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Lsm5P62322 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Lsm5P62322 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Lsm5P62322 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
Lsm5P62322 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Lsm5P62322 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,27■■□□□ 1,16
Lsm5P62322 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Lsm5P62322 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Lsm5P62322 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,24■■□□□ 1,15
Lsm5P62322 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,22■■□□□ 1,15
Lsm5P62322 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Lsm5P62322 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Lsm5P62322 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Lsm5P62322 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Lsm5P62322 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Lsm5P62322 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Lsm5P62322 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Lsm5P62322 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22,14■■□□□ 1,13
Lsm5P62322 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Lsm5P62322 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Lsm5P62322 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22,1■■□□□ 1,13
Lsm5P62322 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Lsm5P62322 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Lsm5P62322 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,11
Lsm5P62322 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Lsm5P62322 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Lsm5P62322 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Lsm5P62322 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Lsm5P62322 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Lsm5P62322 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Lsm5P62322 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Lsm5P62322 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Lsm5P62322 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Lsm5P62322 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Lsm5P62322 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Lsm5P62322 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Lsm5P62322 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21,9■■□□□ 1,1
Lsm5P62322 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Lsm5P62322 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Lsm5P62322 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Lsm5P62322 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Lsm5P62322 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Lsm5P62322 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Lsm5P62322 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Lsm5P62322 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Lsm5P62322 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Lsm5P62322 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Lsm5P62322 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Lsm5P62322 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,81■■□□□ 1,08
Lsm5P62322 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Lsm5P62322 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Lsm5P62322 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,8■■□□□ 1,08
Lsm5P62322 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Lsm5P62322 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Lsm5P62322 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Lsm5P62322 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Lsm5P62322 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Lsm5P62322 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Lsm5P62322 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Lsm5P62322 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21,71■■□□□ 1,07
Lsm5P62322 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Lsm5P62322 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,69■■□□□ 1,06
Lsm5P62322 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Lsm5P62322 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Lsm5P62322 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Lsm5P62322 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Lsm5P62322 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Lsm5P62322 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Lsm5P62322 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Lsm5P62322 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Lsm5P62322 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,6■■□□□ 1,05
Lsm5P62322 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Lsm5P62322 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Lsm5P62322 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Lsm5P62322 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Lsm5P62322 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21,56■■□□□ 1,04
Lsm5P62322 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Lsm5P62322 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Lsm5P62322 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Lsm5P62322 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Lsm5P62322 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Lsm5P62322 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Lsm5P62322 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Lsm5P62322 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,03
Lsm5P62322 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Lsm5P62322 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Lsm5P62322 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Lsm5P62322 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,7 ms