Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Stx1bP61264 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stx1bP61264 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stx1bP61264 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stx1bP61264 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stx1bP61264 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stx1bP61264 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stx1bP61264 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stx1bP61264 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stx1bP61264 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stx1bP61264 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stx1bP61264 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Stx1bP61264 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Stx1bP61264 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stx1bP61264 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stx1bP61264 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stx1bP61264 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Stx1bP61264 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Stx1bP61264 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stx1bP61264 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stx1bP61264 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stx1bP61264 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stx1bP61264 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stx1bP61264 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stx1bP61264 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stx1bP61264 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stx1bP61264 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stx1bP61264 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stx1bP61264 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Stx1bP61264 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx1bP61264 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stx1bP61264 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stx1bP61264 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stx1bP61264 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stx1bP61264 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stx1bP61264 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stx1bP61264 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx1bP61264 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Stx1bP61264 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stx1bP61264 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stx1bP61264 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Stx1bP61264 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx1bP61264 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx1bP61264 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stx1bP61264 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stx1bP61264 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx1bP61264 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx1bP61264 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx1bP61264 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx1bP61264 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx1bP61264 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx1bP61264 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx1bP61264 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stx1bP61264 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stx1bP61264 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stx1bP61264 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx1bP61264 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx1bP61264 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx1bP61264 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stx1bP61264 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stx1bP61264 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx1bP61264 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stx1bP61264 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stx1bP61264 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stx1bP61264 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx1bP61264 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stx1bP61264 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx1bP61264 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx1bP61264 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stx1bP61264 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx1bP61264 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx1bP61264 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx1bP61264 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx1bP61264 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx1bP61264 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx1bP61264 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx1bP61264 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx1bP61264 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Stx1bP61264 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx1bP61264 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx1bP61264 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx1bP61264 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx1bP61264 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx1bP61264 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stx1bP61264 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx1bP61264 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx1bP61264 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx1bP61264 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx1bP61264 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx1bP61264 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx1bP61264 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx1bP61264 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx1bP61264 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx1bP61264 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx1bP61264 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx1bP61264 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx1bP61264 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx1bP61264 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx1bP61264 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx1bP61264 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms