Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab5bP61021 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab5bP61021 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab5bP61021 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab5bP61021 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab5bP61021 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab5bP61021 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab5bP61021 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab5bP61021 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab5bP61021 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab5bP61021 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab5bP61021 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab5bP61021 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab5bP61021 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab5bP61021 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab5bP61021 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab5bP61021 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab5bP61021 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab5bP61021 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab5bP61021 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab5bP61021 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab5bP61021 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab5bP61021 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab5bP61021 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab5bP61021 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab5bP61021 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab5bP61021 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab5bP61021 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab5bP61021 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab5bP61021 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab5bP61021 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab5bP61021 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab5bP61021 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab5bP61021 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab5bP61021 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rab5bP61021 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab5bP61021 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab5bP61021 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab5bP61021 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab5bP61021 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab5bP61021 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab5bP61021 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rab5bP61021 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab5bP61021 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab5bP61021 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab5bP61021 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab5bP61021 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rab5bP61021 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab5bP61021 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab5bP61021 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab5bP61021 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab5bP61021 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab5bP61021 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab5bP61021 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab5bP61021 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab5bP61021 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab5bP61021 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab5bP61021 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab5bP61021 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab5bP61021 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab5bP61021 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab5bP61021 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab5bP61021 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab5bP61021 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab5bP61021 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab5bP61021 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab5bP61021 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab5bP61021 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab5bP61021 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab5bP61021 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab5bP61021 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab5bP61021 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab5bP61021 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab5bP61021 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab5bP61021 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab5bP61021 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab5bP61021 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab5bP61021 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab5bP61021 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab5bP61021 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab5bP61021 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab5bP61021 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab5bP61021 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab5bP61021 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab5bP61021 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab5bP61021 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab5bP61021 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab5bP61021 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab5bP61021 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab5bP61021 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab5bP61021 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab5bP61021 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab5bP61021 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab5bP61021 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab5bP61021 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab5bP61021 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab5bP61021 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab5bP61021 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab5bP61021 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab5bP61021 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms