Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Rab5bP61021 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Rab5bP61021 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Rab5bP61021 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Rab5bP61021 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Rab5bP61021 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Rab5bP61021 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Rab5bP61021 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Rab5bP61021 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Rab5bP61021 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Rab5bP61021 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Rab5bP61021 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Rab5bP61021 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Rab5bP61021 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Rab5bP61021 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Rab5bP61021 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Rab5bP61021 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Rab5bP61021 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,57■■□□□ 1,04
Rab5bP61021 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab5bP61021 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab5bP61021 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Rab5bP61021 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Rab5bP61021 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Rab5bP61021 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Rab5bP61021 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Rab5bP61021 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Rab5bP61021 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Rab5bP61021 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Rab5bP61021 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Rab5bP61021 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Rab5bP61021 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,38■■□□□ 1,01
Rab5bP61021 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Rab5bP61021 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Rab5bP61021 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Rab5bP61021 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,32■■□□□ 1
Rab5bP61021 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Rab5bP61021 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Rab5bP61021 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Rab5bP61021 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Rab5bP61021 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Rab5bP61021 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Rab5bP61021 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■□□□□ 0,99
Rab5bP61021 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Rab5bP61021 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,25■□□□□ 0,99
Rab5bP61021 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Rab5bP61021 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Rab5bP61021 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,99
Rab5bP61021 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Rab5bP61021 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Rab5bP61021 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Rab5bP61021 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Rab5bP61021 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Rab5bP61021 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Rab5bP61021 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Rab5bP61021 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,14■□□□□ 0,97
Rab5bP61021 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Rab5bP61021 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21,13■□□□□ 0,97
Rab5bP61021 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Rab5bP61021 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Rab5bP61021 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Rab5bP61021 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21,12■□□□□ 0,97
Rab5bP61021 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Rab5bP61021 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Rab5bP61021 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,1■□□□□ 0,97
Rab5bP61021 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Rab5bP61021 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Rab5bP61021 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Rab5bP61021 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Rab5bP61021 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Rab5bP61021 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Rab5bP61021 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Rab5bP61021 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Rab5bP61021 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Rab5bP61021 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Rab5bP61021 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Rab5bP61021 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Rab5bP61021 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Rab5bP61021 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rab5bP61021 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rab5bP61021 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rab5bP61021 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Rab5bP61021 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20,99■□□□□ 0,95
Rab5bP61021 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Rab5bP61021 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,98■□□□□ 0,95
Rab5bP61021 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Rab5bP61021 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Rab5bP61021 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Rab5bP61021 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Rab5bP61021 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Rab5bP61021 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20,91■□□□□ 0,94
Rab5bP61021 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Rab5bP61021 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Rab5bP61021 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20,89■□□□□ 0,94
Rab5bP61021 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Rab5bP61021 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Rab5bP61021 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Rab5bP61021 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Rab5bP61021 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Rab5bP61021 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Rab5bP61021 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
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