Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Senp1P59110 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Senp1P59110 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Senp1P59110 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Senp1P59110 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Senp1P59110 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Senp1P59110 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Senp1P59110 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Senp1P59110 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Senp1P59110 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Senp1P59110 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Senp1P59110 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Senp1P59110 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Senp1P59110 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Senp1P59110 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Senp1P59110 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Senp1P59110 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Senp1P59110 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Senp1P59110 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Senp1P59110 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Senp1P59110 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Senp1P59110 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Senp1P59110 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Senp1P59110 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Senp1P59110 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Senp1P59110 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Senp1P59110 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Senp1P59110 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Senp1P59110 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Senp1P59110 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Senp1P59110 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Senp1P59110 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Senp1P59110 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Senp1P59110 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Senp1P59110 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Senp1P59110 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Senp1P59110 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Senp1P59110 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Senp1P59110 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Senp1P59110 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Senp1P59110 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Senp1P59110 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Senp1P59110 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Senp1P59110 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Senp1P59110 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Senp1P59110 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Senp1P59110 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Senp1P59110 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Senp1P59110 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Senp1P59110 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Senp1P59110 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Senp1P59110 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Senp1P59110 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Senp1P59110 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Senp1P59110 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Senp1P59110 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Senp1P59110 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Senp1P59110 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Senp1P59110 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Senp1P59110 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Senp1P59110 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Senp1P59110 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Senp1P59110 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Senp1P59110 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Senp1P59110 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Senp1P59110 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Senp1P59110 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Senp1P59110 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Senp1P59110 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Senp1P59110 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Senp1P59110 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Senp1P59110 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Senp1P59110 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Senp1P59110 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Senp1P59110 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Senp1P59110 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Senp1P59110 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Senp1P59110 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Senp1P59110 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Senp1P59110 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Senp1P59110 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Senp1P59110 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Senp1P59110 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Senp1P59110 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Senp1P59110 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Senp1P59110 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Senp1P59110 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Senp1P59110 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Senp1P59110 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Senp1P59110 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Senp1P59110 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Senp1P59110 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Senp1P59110 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Senp1P59110 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Senp1P59110 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Senp1P59110 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Senp1P59110 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Senp1P59110 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Senp1P59110 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Senp1P59110 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms