Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pdrg1P59048 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pdrg1P59048 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pdrg1P59048 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pdrg1P59048 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pdrg1P59048 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pdrg1P59048 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pdrg1P59048 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pdrg1P59048 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pdrg1P59048 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pdrg1P59048 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pdrg1P59048 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pdrg1P59048 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pdrg1P59048 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Pdrg1P59048 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pdrg1P59048 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pdrg1P59048 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Pdrg1P59048 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pdrg1P59048 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pdrg1P59048 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pdrg1P59048 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pdrg1P59048 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pdrg1P59048 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pdrg1P59048 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pdrg1P59048 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pdrg1P59048 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pdrg1P59048 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pdrg1P59048 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pdrg1P59048 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pdrg1P59048 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pdrg1P59048 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pdrg1P59048 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pdrg1P59048 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Pdrg1P59048 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Pdrg1P59048 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pdrg1P59048 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pdrg1P59048 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pdrg1P59048 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pdrg1P59048 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pdrg1P59048 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pdrg1P59048 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pdrg1P59048 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdrg1P59048 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdrg1P59048 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pdrg1P59048 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pdrg1P59048 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pdrg1P59048 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pdrg1P59048 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pdrg1P59048 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdrg1P59048 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdrg1P59048 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pdrg1P59048 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pdrg1P59048 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pdrg1P59048 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pdrg1P59048 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pdrg1P59048 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pdrg1P59048 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Pdrg1P59048 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pdrg1P59048 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pdrg1P59048 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pdrg1P59048 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pdrg1P59048 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdrg1P59048 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdrg1P59048 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdrg1P59048 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdrg1P59048 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pdrg1P59048 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pdrg1P59048 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdrg1P59048 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdrg1P59048 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdrg1P59048 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdrg1P59048 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pdrg1P59048 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pdrg1P59048 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pdrg1P59048 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdrg1P59048 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pdrg1P59048 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdrg1P59048 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdrg1P59048 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdrg1P59048 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdrg1P59048 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdrg1P59048 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdrg1P59048 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pdrg1P59048 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Pdrg1P59048 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pdrg1P59048 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdrg1P59048 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdrg1P59048 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdrg1P59048 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pdrg1P59048 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdrg1P59048 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdrg1P59048 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdrg1P59048 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdrg1P59048 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pdrg1P59048 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdrg1P59048 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdrg1P59048 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdrg1P59048 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdrg1P59048 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdrg1P59048 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms