Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cox7bP56393 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cox7bP56393 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cox7bP56393 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cox7bP56393 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox7bP56393 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox7bP56393 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox7bP56393 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox7bP56393 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox7bP56393 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox7bP56393 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox7bP56393 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cox7bP56393 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox7bP56393 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox7bP56393 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox7bP56393 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox7bP56393 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox7bP56393 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cox7bP56393 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cox7bP56393 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cox7bP56393 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cox7bP56393 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cox7bP56393 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cox7bP56393 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cox7bP56393 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cox7bP56393 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cox7bP56393 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cox7bP56393 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cox7bP56393 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cox7bP56393 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cox7bP56393 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cox7bP56393 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cox7bP56393 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cox7bP56393 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cox7bP56393 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cox7bP56393 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cox7bP56393 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox7bP56393 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox7bP56393 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox7bP56393 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cox7bP56393 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cox7bP56393 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cox7bP56393 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cox7bP56393 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cox7bP56393 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox7bP56393 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox7bP56393 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cox7bP56393 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cox7bP56393 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cox7bP56393 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cox7bP56393 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cox7bP56393 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cox7bP56393 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cox7bP56393 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cox7bP56393 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cox7bP56393 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cox7bP56393 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cox7bP56393 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cox7bP56393 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cox7bP56393 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox7bP56393 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox7bP56393 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox7bP56393 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox7bP56393 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox7bP56393 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox7bP56393 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox7bP56393 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox7bP56393 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox7bP56393 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox7bP56393 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox7bP56393 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox7bP56393 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox7bP56393 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox7bP56393 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox7bP56393 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox7bP56393 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox7bP56393 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox7bP56393 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cox7bP56393 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cox7bP56393 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cox7bP56393 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cox7bP56393 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cox7bP56393 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cox7bP56393 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cox7bP56393 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cox7bP56393 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cox7bP56393 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cox7bP56393 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox7bP56393 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cox7bP56393 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cox7bP56393 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cox7bP56393 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox7bP56393 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox7bP56393 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox7bP56393 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox7bP56393 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox7bP56393 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox7bP56393 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox7bP56393 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cox7bP56393 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms