Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GferP56213 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GferP56213 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GferP56213 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GferP56213 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GferP56213 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GferP56213 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GferP56213 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GferP56213 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GferP56213 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GferP56213 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GferP56213 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GferP56213 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GferP56213 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GferP56213 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GferP56213 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GferP56213 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GferP56213 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GferP56213 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GferP56213 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GferP56213 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GferP56213 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GferP56213 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GferP56213 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GferP56213 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GferP56213 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GferP56213 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GferP56213 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GferP56213 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GferP56213 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GferP56213 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GferP56213 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GferP56213 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GferP56213 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GferP56213 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GferP56213 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GferP56213 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GferP56213 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GferP56213 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GferP56213 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GferP56213 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GferP56213 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GferP56213 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GferP56213 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GferP56213 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GferP56213 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GferP56213 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GferP56213 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GferP56213 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GferP56213 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GferP56213 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GferP56213 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GferP56213 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GferP56213 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GferP56213 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GferP56213 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GferP56213 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GferP56213 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GferP56213 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GferP56213 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GferP56213 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GferP56213 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GferP56213 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GferP56213 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GferP56213 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GferP56213 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GferP56213 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GferP56213 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GferP56213 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GferP56213 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GferP56213 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GferP56213 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GferP56213 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GferP56213 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GferP56213 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GferP56213 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GferP56213 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GferP56213 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GferP56213 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GferP56213 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GferP56213 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GferP56213 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GferP56213 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GferP56213 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GferP56213 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GferP56213 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GferP56213 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GferP56213 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GferP56213 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GferP56213 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GferP56213 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GferP56213 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GferP56213 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GferP56213 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GferP56213 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GferP56213 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GferP56213 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GferP56213 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GferP56213 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GferP56213 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms