Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cav1P49817 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cav1P49817 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cav1P49817 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cav1P49817 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cav1P49817 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cav1P49817 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cav1P49817 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cav1P49817 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cav1P49817 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cav1P49817 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cav1P49817 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cav1P49817 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cav1P49817 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cav1P49817 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cav1P49817 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cav1P49817 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cav1P49817 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cav1P49817 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cav1P49817 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cav1P49817 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cav1P49817 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cav1P49817 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cav1P49817 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cav1P49817 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cav1P49817 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cav1P49817 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cav1P49817 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cav1P49817 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cav1P49817 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cav1P49817 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cav1P49817 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cav1P49817 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cav1P49817 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cav1P49817 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cav1P49817 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cav1P49817 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cav1P49817 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cav1P49817 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Cav1P49817 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cav1P49817 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cav1P49817 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cav1P49817 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cav1P49817 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cav1P49817 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cav1P49817 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cav1P49817 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cav1P49817 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Cav1P49817 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cav1P49817 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cav1P49817 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cav1P49817 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cav1P49817 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cav1P49817 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cav1P49817 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cav1P49817 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cav1P49817 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cav1P49817 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cav1P49817 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cav1P49817 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cav1P49817 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cav1P49817 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cav1P49817 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cav1P49817 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cav1P49817 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cav1P49817 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cav1P49817 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cav1P49817 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cav1P49817 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cav1P49817 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cav1P49817 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cav1P49817 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cav1P49817 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cav1P49817 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cav1P49817 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cav1P49817 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cav1P49817 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cav1P49817 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cav1P49817 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cav1P49817 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cav1P49817 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cav1P49817 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cav1P49817 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cav1P49817 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cav1P49817 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cav1P49817 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cav1P49817 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cav1P49817 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cav1P49817 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cav1P49817 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cav1P49817 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cav1P49817 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cav1P49817 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cav1P49817 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cav1P49817 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cav1P49817 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cav1P49817 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cav1P49817 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cav1P49817 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cav1P49817 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms