Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,27■■■□□ 2,12
LmnaP48678 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
LmnaP48678 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,25■■■□□ 2,11
LmnaP48678 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
LmnaP48678 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
LmnaP48678 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
LmnaP48678 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
LmnaP48678 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
LmnaP48678 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
LmnaP48678 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
LmnaP48678 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
LmnaP48678 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
LmnaP48678 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,14■■■□□ 2,1
LmnaP48678 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
LmnaP48678 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
LmnaP48678 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,1■■■□□ 2,09
LmnaP48678 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
LmnaP48678 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
LmnaP48678 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
LmnaP48678 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
LmnaP48678 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
LmnaP48678 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
LmnaP48678 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
LmnaP48678 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
LmnaP48678 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28■■■□□ 2,07
LmnaP48678 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
LmnaP48678 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
LmnaP48678 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
LmnaP48678 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27,96■■■□□ 2,07
LmnaP48678 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
LmnaP48678 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
LmnaP48678 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
LmnaP48678 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
LmnaP48678 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
LmnaP48678 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
LmnaP48678 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
LmnaP48678 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
LmnaP48678 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
LmnaP48678 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
LmnaP48678 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
LmnaP48678 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
LmnaP48678 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
LmnaP48678 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
LmnaP48678 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
LmnaP48678 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
LmnaP48678 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
LmnaP48678 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
LmnaP48678 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
LmnaP48678 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
LmnaP48678 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
LmnaP48678 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
LmnaP48678 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
LmnaP48678 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
LmnaP48678 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
LmnaP48678 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
LmnaP48678 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,49■■□□□ 1,99
LmnaP48678 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
LmnaP48678 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
LmnaP48678 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
LmnaP48678 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
LmnaP48678 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
LmnaP48678 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
LmnaP48678 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
LmnaP48678 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
LmnaP48678 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
LmnaP48678 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
LmnaP48678 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
LmnaP48678 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
LmnaP48678 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
LmnaP48678 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
LmnaP48678 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,26■■□□□ 1,95
LmnaP48678 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
LmnaP48678 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
LmnaP48678 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
LmnaP48678 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
LmnaP48678 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
LmnaP48678 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
LmnaP48678 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
LmnaP48678 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
LmnaP48678 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
LmnaP48678 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,13■■□□□ 1,93
LmnaP48678 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
LmnaP48678 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
LmnaP48678 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
LmnaP48678 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,09■■□□□ 1,93
LmnaP48678 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
LmnaP48678 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
LmnaP48678 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
LmnaP48678 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
LmnaP48678 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,05■■□□□ 1,92
LmnaP48678 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
LmnaP48678 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
LmnaP48678 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26,99■■□□□ 1,91
LmnaP48678 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
LmnaP48678 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
LmnaP48678 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
LmnaP48678 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
LmnaP48678 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
LmnaP48678 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
LmnaP48678 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40,4 ms