Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox2P48432 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox2P48432 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox2P48432 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox2P48432 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox2P48432 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox2P48432 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox2P48432 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox2P48432 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sox2P48432 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sox2P48432 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox2P48432 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox2P48432 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox2P48432 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sox2P48432 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox2P48432 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox2P48432 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox2P48432 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox2P48432 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox2P48432 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox2P48432 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox2P48432 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox2P48432 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox2P48432 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox2P48432 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox2P48432 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox2P48432 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox2P48432 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox2P48432 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox2P48432 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox2P48432 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox2P48432 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sox2P48432 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sox2P48432 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox2P48432 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox2P48432 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox2P48432 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox2P48432 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sox2P48432 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sox2P48432 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox2P48432 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox2P48432 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox2P48432 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox2P48432 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox2P48432 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sox2P48432 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox2P48432 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox2P48432 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox2P48432 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox2P48432 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox2P48432 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox2P48432 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox2P48432 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox2P48432 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox2P48432 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox2P48432 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox2P48432 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox2P48432 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox2P48432 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox2P48432 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox2P48432 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox2P48432 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox2P48432 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox2P48432 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox2P48432 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sox2P48432 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sox2P48432 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox2P48432 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox2P48432 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox2P48432 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sox2P48432 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox2P48432 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox2P48432 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox2P48432 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox2P48432 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox2P48432 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox2P48432 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox2P48432 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox2P48432 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox2P48432 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox2P48432 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox2P48432 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox2P48432 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox2P48432 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox2P48432 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox2P48432 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox2P48432 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox2P48432 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox2P48432 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox2P48432 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox2P48432 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox2P48432 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox2P48432 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox2P48432 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox2P48432 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox2P48432 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox2P48432 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox2P48432 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox2P48432 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox2P48432 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 343.4 ms