Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Klf1P46099 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Klf1P46099 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Klf1P46099 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Klf1P46099 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Klf1P46099 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Klf1P46099 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Klf1P46099 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Klf1P46099 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Klf1P46099 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Klf1P46099 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Klf1P46099 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Klf1P46099 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Klf1P46099 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Klf1P46099 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Klf1P46099 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Klf1P46099 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Klf1P46099 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Klf1P46099 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Klf1P46099 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Klf1P46099 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Klf1P46099 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Klf1P46099 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Klf1P46099 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Klf1P46099 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Klf1P46099 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Klf1P46099 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Klf1P46099 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Klf1P46099 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Klf1P46099 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Klf1P46099 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Klf1P46099 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Klf1P46099 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Klf1P46099 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Klf1P46099 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Klf1P46099 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Klf1P46099 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Klf1P46099 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Klf1P46099 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Klf1P46099 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Klf1P46099 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klf1P46099 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klf1P46099 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Klf1P46099 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Klf1P46099 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Klf1P46099 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Klf1P46099 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klf1P46099 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Klf1P46099 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Klf1P46099 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Klf1P46099 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Klf1P46099 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Klf1P46099 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Klf1P46099 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Klf1P46099 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Klf1P46099 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Klf1P46099 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Klf1P46099 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Klf1P46099 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Klf1P46099 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Klf1P46099 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Klf1P46099 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Klf1P46099 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Klf1P46099 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Klf1P46099 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Klf1P46099 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Klf1P46099 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Klf1P46099 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Klf1P46099 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Klf1P46099 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Klf1P46099 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Klf1P46099 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Klf1P46099 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Klf1P46099 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Klf1P46099 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Klf1P46099 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Klf1P46099 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Klf1P46099 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Klf1P46099 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Klf1P46099 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Klf1P46099 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Klf1P46099 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Klf1P46099 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Klf1P46099 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Klf1P46099 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Klf1P46099 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Klf1P46099 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klf1P46099 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klf1P46099 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klf1P46099 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Klf1P46099 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Klf1P46099 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Klf1P46099 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Klf1P46099 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Klf1P46099 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Klf1P46099 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Klf1P46099 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Klf1P46099 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Klf1P46099 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Klf1P46099 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 249.5 ms