Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Syt1P46096 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Syt1P46096 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Syt1P46096 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Syt1P46096 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Syt1P46096 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Syt1P46096 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Syt1P46096 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Syt1P46096 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Syt1P46096 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Syt1P46096 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Syt1P46096 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Syt1P46096 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Syt1P46096 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Syt1P46096 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Syt1P46096 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Syt1P46096 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Syt1P46096 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Syt1P46096 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Syt1P46096 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Syt1P46096 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Syt1P46096 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Syt1P46096 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Syt1P46096 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Syt1P46096 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Syt1P46096 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Syt1P46096 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Syt1P46096 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Syt1P46096 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Syt1P46096 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Syt1P46096 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Syt1P46096 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Syt1P46096 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Syt1P46096 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Syt1P46096 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Syt1P46096 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Syt1P46096 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Syt1P46096 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Syt1P46096 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Syt1P46096 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Syt1P46096 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Syt1P46096 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Syt1P46096 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Syt1P46096 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Syt1P46096 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Syt1P46096 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Syt1P46096 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Syt1P46096 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Syt1P46096 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Syt1P46096 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Syt1P46096 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Syt1P46096 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Syt1P46096 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Syt1P46096 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Syt1P46096 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Syt1P46096 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Syt1P46096 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Syt1P46096 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Syt1P46096 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Syt1P46096 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Syt1P46096 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Syt1P46096 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Syt1P46096 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Syt1P46096 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Syt1P46096 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Syt1P46096 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Syt1P46096 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Syt1P46096 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Syt1P46096 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Syt1P46096 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Syt1P46096 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Syt1P46096 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Syt1P46096 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Syt1P46096 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Syt1P46096 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Syt1P46096 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Syt1P46096 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Syt1P46096 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Syt1P46096 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Syt1P46096 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Syt1P46096 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Syt1P46096 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Syt1P46096 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Syt1P46096 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Syt1P46096 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Syt1P46096 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Syt1P46096 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Syt1P46096 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Syt1P46096 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Syt1P46096 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Syt1P46096 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Syt1P46096 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Syt1P46096 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Syt1P46096 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Syt1P46096 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Syt1P46096 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Syt1P46096 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Syt1P46096 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Syt1P46096 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Syt1P46096 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms