Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Sdc2P43407 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Sdc2P43407 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Sdc2P43407 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Sdc2P43407 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Sdc2P43407 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Sdc2P43407 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Sdc2P43407 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Sdc2P43407 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Sdc2P43407 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Sdc2P43407 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Sdc2P43407 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Sdc2P43407 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Sdc2P43407 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Sdc2P43407 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Sdc2P43407 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Sdc2P43407 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Sdc2P43407 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,49■■■□□ 2,47
Sdc2P43407 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Sdc2P43407 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Sdc2P43407 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Sdc2P43407 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Sdc2P43407 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Sdc2P43407 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,36■■■□□ 2,45
Sdc2P43407 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Sdc2P43407 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Sdc2P43407 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Sdc2P43407 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Sdc2P43407 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Sdc2P43407 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
Sdc2P43407 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Sdc2P43407 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Sdc2P43407 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Sdc2P43407 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Sdc2P43407 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Sdc2P43407 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Sdc2P43407 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Sdc2P43407 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Sdc2P43407 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Sdc2P43407 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Sdc2P43407 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Sdc2P43407 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Sdc2P43407 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Sdc2P43407 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Sdc2P43407 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Sdc2P43407 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Sdc2P43407 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Sdc2P43407 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Sdc2P43407 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Sdc2P43407 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Sdc2P43407 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Sdc2P43407 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Sdc2P43407 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Sdc2P43407 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Sdc2P43407 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Sdc2P43407 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Sdc2P43407 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Sdc2P43407 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Sdc2P43407 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Sdc2P43407 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Sdc2P43407 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Sdc2P43407 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Sdc2P43407 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Sdc2P43407 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Sdc2P43407 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Sdc2P43407 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Sdc2P43407 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
Sdc2P43407 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Sdc2P43407 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Sdc2P43407 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Sdc2P43407 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Sdc2P43407 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Sdc2P43407 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Sdc2P43407 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Sdc2P43407 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Sdc2P43407 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Sdc2P43407 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Sdc2P43407 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
Sdc2P43407 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Sdc2P43407 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Sdc2P43407 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Sdc2P43407 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Sdc2P43407 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,49■■■□□ 2,31
Sdc2P43407 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Sdc2P43407 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Sdc2P43407 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Sdc2P43407 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Sdc2P43407 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Sdc2P43407 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Sdc2P43407 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Sdc2P43407 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Sdc2P43407 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Sdc2P43407 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Sdc2P43407 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Sdc2P43407 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Sdc2P43407 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Sdc2P43407 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Sdc2P43407 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Sdc2P43407 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Sdc2P43407 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,7 ms