Protein–RNA interactions for Protein: P42208

Sept2, Septin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept2P42208 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32,82■■■□□ 2,84
Sept2P42208 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Sept2P42208 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,77■■■□□ 2,84
Sept2P42208 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,76■■■□□ 2,84
Sept2P42208 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Sept2P42208 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Sept2P42208 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Sept2P42208 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Sept2P42208 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Sept2P42208 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32,6■■■□□ 2,81
Sept2P42208 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32,47■■■□□ 2,79
Sept2P42208 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Sept2P42208 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Sept2P42208 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Sept2P42208 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Sept2P42208 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Sept2P42208 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Sept2P42208 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32,34■■■□□ 2,77
Sept2P42208 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Sept2P42208 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Sept2P42208 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Sept2P42208 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Sept2P42208 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Sept2P42208 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Sept2P42208 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Sept2P42208 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Sept2P42208 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Sept2P42208 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Sept2P42208 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,07■■■□□ 2,73
Sept2P42208 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Sept2P42208 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32,01■■■□□ 2,71
Sept2P42208 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,01■■■□□ 2,71
Sept2P42208 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31,99■■■□□ 2,71
Sept2P42208 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Sept2P42208 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31,96■■■□□ 2,71
Sept2P42208 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31,92■■■□□ 2,7
Sept2P42208 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Sept2P42208 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Sept2P42208 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Sept2P42208 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,69
Sept2P42208 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Sept2P42208 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31,81■■■□□ 2,68
Sept2P42208 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Sept2P42208 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Sept2P42208 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31,77■■■□□ 2,68
Sept2P42208 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Sept2P42208 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Sept2P42208 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Sept2P42208 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31,7■■■□□ 2,67
Sept2P42208 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Sept2P42208 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Sept2P42208 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31,63■■■□□ 2,65
Sept2P42208 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Sept2P42208 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Sept2P42208 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Sept2P42208 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Sept2P42208 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Sept2P42208 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Sept2P42208 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Sept2P42208 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,45■■■□□ 2,62
Sept2P42208 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Sept2P42208 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31,43■■■□□ 2,62
Sept2P42208 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Sept2P42208 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Sept2P42208 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Sept2P42208 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Sept2P42208 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31,38■■■□□ 2,61
Sept2P42208 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Sept2P42208 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Sept2P42208 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Sept2P42208 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Sept2P42208 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,6
Sept2P42208 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Sept2P42208 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Sept2P42208 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Sept2P42208 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31,15■■■□□ 2,58
Sept2P42208 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Sept2P42208 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Sept2P42208 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Sept2P42208 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31,08■■■□□ 2,57
Sept2P42208 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Sept2P42208 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Sept2P42208 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Sept2P42208 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Sept2P42208 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Sept2P42208 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Sept2P42208 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Sept2P42208 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Sept2P42208 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30,98■■■□□ 2,55
Sept2P42208 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Sept2P42208 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Sept2P42208 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Sept2P42208 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Sept2P42208 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Sept2P42208 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Sept2P42208 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30,92■■■□□ 2,54
Sept2P42208 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Sept2P42208 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Sept2P42208 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Sept2P42208 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,3 ms