Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Cap1P40124 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Cap1P40124 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Cap1P40124 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Cap1P40124 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Cap1P40124 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Cap1P40124 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Cap1P40124 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Cap1P40124 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Cap1P40124 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Cap1P40124 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Cap1P40124 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Cap1P40124 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Cap1P40124 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,26■■■□□ 2,91
Cap1P40124 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,25■■■□□ 2,91
Cap1P40124 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Cap1P40124 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,22■■■□□ 2,91
Cap1P40124 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Cap1P40124 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Cap1P40124 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Cap1P40124 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Cap1P40124 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Cap1P40124 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Cap1P40124 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33,04■■■□□ 2,88
Cap1P40124 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,02■■■□□ 2,88
Cap1P40124 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Cap1P40124 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2,87
Cap1P40124 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Cap1P40124 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Cap1P40124 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Cap1P40124 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Cap1P40124 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Cap1P40124 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Cap1P40124 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Cap1P40124 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Cap1P40124 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Cap1P40124 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Cap1P40124 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32,85■■■□□ 2,85
Cap1P40124 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Cap1P40124 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Cap1P40124 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Cap1P40124 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Cap1P40124 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Cap1P40124 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Cap1P40124 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32,7■■■□□ 2,83
Cap1P40124 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,82
Cap1P40124 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Cap1P40124 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Cap1P40124 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,67■■■□□ 2,82
Cap1P40124 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32,63■■■□□ 2,81
Cap1P40124 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Cap1P40124 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Cap1P40124 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32,56■■■□□ 2,8
Cap1P40124 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Cap1P40124 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Cap1P40124 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Cap1P40124 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Cap1P40124 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,45■■■□□ 2,78
Cap1P40124 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Cap1P40124 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Cap1P40124 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Cap1P40124 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Cap1P40124 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Cap1P40124 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Cap1P40124 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32,32■■■□□ 2,76
Cap1P40124 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Cap1P40124 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Cap1P40124 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Cap1P40124 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Cap1P40124 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,27■■■□□ 2,76
Cap1P40124 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Cap1P40124 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Cap1P40124 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Cap1P40124 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Cap1P40124 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Cap1P40124 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,11■■■□□ 2,73
Cap1P40124 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Cap1P40124 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32,1■■■□□ 2,73
Cap1P40124 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,08■■■□□ 2,73
Cap1P40124 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC32,08■■■□□ 2,73
Cap1P40124 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32,06■■■□□ 2,72
Cap1P40124 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32,04■■■□□ 2,72
Cap1P40124 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Cap1P40124 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Cap1P40124 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Cap1P40124 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32,02■■■□□ 2,72
Cap1P40124 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,72
Cap1P40124 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,72
Cap1P40124 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32,01■■■□□ 2,71
Cap1P40124 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Cap1P40124 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Cap1P40124 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31,94■■■□□ 2,7
Cap1P40124 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31,94■■■□□ 2,7
Cap1P40124 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Cap1P40124 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Cap1P40124 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Cap1P40124 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Cap1P40124 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31,89■■■□□ 2,7
Cap1P40124 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31,88■■■□□ 2,69
Cap1P40124 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,1 ms