Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Tjp1P39447 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Tjp1P39447 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,33■■■■□ 3,41
Tjp1P39447 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,41
Tjp1P39447 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36,29■■■■□ 3,4
Tjp1P39447 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Tjp1P39447 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,26■■■■□ 3,4
Tjp1P39447 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Tjp1P39447 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Tjp1P39447 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36,22■■■■□ 3,39
Tjp1P39447 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36,18■■■■□ 3,38
Tjp1P39447 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Tjp1P39447 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36,17■■■■□ 3,38
Tjp1P39447 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Tjp1P39447 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Tjp1P39447 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36,11■■■■□ 3,37
Tjp1P39447 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Tjp1P39447 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Tjp1P39447 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36,03■■■■□ 3,36
Tjp1P39447 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Tjp1P39447 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Tjp1P39447 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Tjp1P39447 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Tjp1P39447 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35,71■■■■□ 3,31
Tjp1P39447 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35,69■■■■□ 3,3
Tjp1P39447 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Tjp1P39447 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Tjp1P39447 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Tjp1P39447 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35,63■■■■□ 3,29
Tjp1P39447 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Tjp1P39447 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Tjp1P39447 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Tjp1P39447 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35,58■■■■□ 3,29
Tjp1P39447 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Tjp1P39447 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35,52■■■■□ 3,28
Tjp1P39447 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Tjp1P39447 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Tjp1P39447 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35,51■■■■□ 3,28
Tjp1P39447 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35,5■■■■□ 3,27
Tjp1P39447 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Tjp1P39447 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Tjp1P39447 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35,46■■■■□ 3,27
Tjp1P39447 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,26
Tjp1P39447 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Tjp1P39447 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Tjp1P39447 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Tjp1P39447 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Tjp1P39447 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Tjp1P39447 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Tjp1P39447 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Tjp1P39447 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,2■■■■□ 3,23
Tjp1P39447 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Tjp1P39447 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Tjp1P39447 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Tjp1P39447 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Tjp1P39447 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Tjp1P39447 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Tjp1P39447 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Tjp1P39447 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Tjp1P39447 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Tjp1P39447 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Tjp1P39447 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Tjp1P39447 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Tjp1P39447 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Tjp1P39447 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Tjp1P39447 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Tjp1P39447 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,19
Tjp1P39447 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,99■■■■□ 3,19
Tjp1P39447 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Tjp1P39447 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,93■■■■□ 3,18
Tjp1P39447 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Tjp1P39447 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34,9■■■■□ 3,18
Tjp1P39447 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34,83■■■■□ 3,17
Tjp1P39447 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,78■■■■□ 3,16
Tjp1P39447 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Tjp1P39447 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Tjp1P39447 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
Tjp1P39447 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,74■■■■□ 3,15
Tjp1P39447 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Tjp1P39447 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Tjp1P39447 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,68■■■■□ 3,14
Tjp1P39447 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34,67■■■■□ 3,14
Tjp1P39447 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Tjp1P39447 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34,64■■■■□ 3,14
Tjp1P39447 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,6■■■■□ 3,13
Tjp1P39447 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34,6■■■■□ 3,13
Tjp1P39447 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34,59■■■■□ 3,13
Tjp1P39447 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Tjp1P39447 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Tjp1P39447 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34,58■■■■□ 3,13
Tjp1P39447 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,13
Tjp1P39447 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Tjp1P39447 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34,55■■■■□ 3,12
Tjp1P39447 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Tjp1P39447 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Tjp1P39447 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Tjp1P39447 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Tjp1P39447 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Tjp1P39447 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34,44■■■■□ 3,1
Tjp1P39447 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48,7 ms