Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Upk2P38575 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Upk2P38575 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Upk2P38575 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Upk2P38575 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,35■■□□□ 1,49
Upk2P38575 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Upk2P38575 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Upk2P38575 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Upk2P38575 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Upk2P38575 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Upk2P38575 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,25■■□□□ 1,47
Upk2P38575 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Upk2P38575 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Upk2P38575 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,2■■□□□ 1,46
Upk2P38575 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Upk2P38575 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Upk2P38575 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
Upk2P38575 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Upk2P38575 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Upk2P38575 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,05■■□□□ 1,44
Upk2P38575 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Upk2P38575 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Upk2P38575 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,02■■□□□ 1,44
Upk2P38575 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,02■■□□□ 1,44
Upk2P38575 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Upk2P38575 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Upk2P38575 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,97■■□□□ 1,43
Upk2P38575 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Upk2P38575 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Upk2P38575 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Upk2P38575 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Upk2P38575 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,93■■□□□ 1,42
Upk2P38575 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Upk2P38575 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Upk2P38575 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Upk2P38575 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Upk2P38575 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,88■■□□□ 1,41
Upk2P38575 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Upk2P38575 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Upk2P38575 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Upk2P38575 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Upk2P38575 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
Upk2P38575 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Upk2P38575 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Upk2P38575 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Upk2P38575 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Upk2P38575 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
Upk2P38575 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Upk2P38575 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Upk2P38575 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Upk2P38575 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Upk2P38575 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Upk2P38575 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Upk2P38575 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Upk2P38575 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Upk2P38575 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Upk2P38575 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Upk2P38575 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Upk2P38575 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Upk2P38575 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Upk2P38575 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Upk2P38575 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23,47■■□□□ 1,35
Upk2P38575 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Upk2P38575 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Upk2P38575 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Upk2P38575 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Upk2P38575 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23,43■■□□□ 1,34
Upk2P38575 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Upk2P38575 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Upk2P38575 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Upk2P38575 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Upk2P38575 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Upk2P38575 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Upk2P38575 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Upk2P38575 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Upk2P38575 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Upk2P38575 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Upk2P38575 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Upk2P38575 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Upk2P38575 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23,32■■□□□ 1,32
Upk2P38575 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Upk2P38575 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Upk2P38575 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23,29■■□□□ 1,32
Upk2P38575 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23,29■■□□□ 1,32
Upk2P38575 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
Upk2P38575 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Upk2P38575 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Upk2P38575 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Upk2P38575 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Upk2P38575 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Upk2P38575 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23,21■■□□□ 1,31
Upk2P38575 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Upk2P38575 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Upk2P38575 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Upk2P38575 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
Upk2P38575 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Upk2P38575 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Upk2P38575 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Upk2P38575 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Upk2P38575 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,8 ms