Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
KdrP35918 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
KdrP35918 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
KdrP35918 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
KdrP35918 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
KdrP35918 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
KdrP35918 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
KdrP35918 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
KdrP35918 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
KdrP35918 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
KdrP35918 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
KdrP35918 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
KdrP35918 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
KdrP35918 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
KdrP35918 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
KdrP35918 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
KdrP35918 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
KdrP35918 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
KdrP35918 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
KdrP35918 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
KdrP35918 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
KdrP35918 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
KdrP35918 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
KdrP35918 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
KdrP35918 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
KdrP35918 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
KdrP35918 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
KdrP35918 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
KdrP35918 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
KdrP35918 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
KdrP35918 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
KdrP35918 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
KdrP35918 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
KdrP35918 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
KdrP35918 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
KdrP35918 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
KdrP35918 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
KdrP35918 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
KdrP35918 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
KdrP35918 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
KdrP35918 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
KdrP35918 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
KdrP35918 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
KdrP35918 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
KdrP35918 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
KdrP35918 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
KdrP35918 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
KdrP35918 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
KdrP35918 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
KdrP35918 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
KdrP35918 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
KdrP35918 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
KdrP35918 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
KdrP35918 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KdrP35918 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
KdrP35918 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KdrP35918 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KdrP35918 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
KdrP35918 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
KdrP35918 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
KdrP35918 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KdrP35918 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
KdrP35918 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
KdrP35918 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
KdrP35918 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
KdrP35918 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
KdrP35918 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
KdrP35918 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KdrP35918 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
KdrP35918 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
KdrP35918 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
KdrP35918 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
KdrP35918 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
KdrP35918 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
KdrP35918 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KdrP35918 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KdrP35918 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
KdrP35918 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
KdrP35918 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
KdrP35918 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KdrP35918 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
KdrP35918 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
KdrP35918 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
KdrP35918 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
KdrP35918 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
KdrP35918 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
KdrP35918 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KdrP35918 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
KdrP35918 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
KdrP35918 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KdrP35918 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
KdrP35918 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
KdrP35918 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
KdrP35918 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
KdrP35918 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KdrP35918 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
KdrP35918 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KdrP35918 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
KdrP35918 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
KdrP35918 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms