Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1,75
Rab17P35292 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Rab17P35292 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Rab17P35292 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Rab17P35292 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Rab17P35292 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rab17P35292 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Rab17P35292 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Rab17P35292 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Rab17P35292 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Rab17P35292 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Rab17P35292 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rab17P35292 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rab17P35292 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Rab17P35292 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
Rab17P35292 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Rab17P35292 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rab17P35292 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,53■■□□□ 1,68
Rab17P35292 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rab17P35292 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rab17P35292 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Rab17P35292 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rab17P35292 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rab17P35292 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rab17P35292 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rab17P35292 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rab17P35292 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Rab17P35292 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Rab17P35292 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Rab17P35292 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Rab17P35292 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Rab17P35292 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
Rab17P35292 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rab17P35292 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Rab17P35292 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Rab17P35292 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Rab17P35292 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Rab17P35292 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Rab17P35292 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Rab17P35292 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Rab17P35292 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,22■■□□□ 1,63
Rab17P35292 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Rab17P35292 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Rab17P35292 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Rab17P35292 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Rab17P35292 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Rab17P35292 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Rab17P35292 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Rab17P35292 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Rab17P35292 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Rab17P35292 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Rab17P35292 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Rab17P35292 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Rab17P35292 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Rab17P35292 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Rab17P35292 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Rab17P35292 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Rab17P35292 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Rab17P35292 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Rab17P35292 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Rab17P35292 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Rab17P35292 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Rab17P35292 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Rab17P35292 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Rab17P35292 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Rab17P35292 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Rab17P35292 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Rab17P35292 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Rab17P35292 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Rab17P35292 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
Rab17P35292 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Rab17P35292 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Rab17P35292 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Rab17P35292 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Rab17P35292 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Rab17P35292 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rab17P35292 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Rab17P35292 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Rab17P35292 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Rab17P35292 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Rab17P35292 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Rab17P35292 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Rab17P35292 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Rab17P35292 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Rab17P35292 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Rab17P35292 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Rab17P35292 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Rab17P35292 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Rab17P35292 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Rab17P35292 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Rab17P35292 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Rab17P35292 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Rab17P35292 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Rab17P35292 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Rab17P35292 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Rab17P35292 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Rab17P35292 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Rab17P35292 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Rab17P35292 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Rab17P35292 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85,1 ms