Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab5cP35278 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab5cP35278 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab5cP35278 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab5cP35278 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab5cP35278 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab5cP35278 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab5cP35278 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab5cP35278 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab5cP35278 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab5cP35278 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab5cP35278 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rab5cP35278 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab5cP35278 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab5cP35278 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab5cP35278 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab5cP35278 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab5cP35278 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab5cP35278 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab5cP35278 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab5cP35278 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab5cP35278 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab5cP35278 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab5cP35278 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab5cP35278 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab5cP35278 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab5cP35278 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab5cP35278 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab5cP35278 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab5cP35278 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab5cP35278 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab5cP35278 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab5cP35278 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab5cP35278 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab5cP35278 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab5cP35278 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab5cP35278 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab5cP35278 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab5cP35278 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab5cP35278 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab5cP35278 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab5cP35278 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab5cP35278 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab5cP35278 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab5cP35278 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab5cP35278 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab5cP35278 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rab5cP35278 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab5cP35278 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab5cP35278 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab5cP35278 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab5cP35278 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab5cP35278 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab5cP35278 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab5cP35278 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab5cP35278 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab5cP35278 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab5cP35278 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab5cP35278 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rab5cP35278 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab5cP35278 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab5cP35278 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab5cP35278 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab5cP35278 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab5cP35278 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab5cP35278 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab5cP35278 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab5cP35278 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab5cP35278 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab5cP35278 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab5cP35278 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab5cP35278 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab5cP35278 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab5cP35278 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab5cP35278 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab5cP35278 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab5cP35278 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab5cP35278 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab5cP35278 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab5cP35278 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rab5cP35278 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab5cP35278 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab5cP35278 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab5cP35278 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab5cP35278 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab5cP35278 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab5cP35278 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab5cP35278 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab5cP35278 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab5cP35278 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab5cP35278 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab5cP35278 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab5cP35278 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab5cP35278 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab5cP35278 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab5cP35278 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab5cP35278 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab5cP35278 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab5cP35278 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab5cP35278 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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