Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Ptpn11P35235 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Ptpn11P35235 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Ptpn11P35235 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Ptpn11P35235 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,95■■■□□ 2,55
Ptpn11P35235 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Ptpn11P35235 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Ptpn11P35235 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Ptpn11P35235 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,91■■■□□ 2,54
Ptpn11P35235 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Ptpn11P35235 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Ptpn11P35235 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Ptpn11P35235 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,8■■■□□ 2,52
Ptpn11P35235 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Ptpn11P35235 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Ptpn11P35235 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,75■■■□□ 2,51
Ptpn11P35235 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,73■■■□□ 2,51
Ptpn11P35235 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Ptpn11P35235 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Ptpn11P35235 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Ptpn11P35235 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Ptpn11P35235 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Ptpn11P35235 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Ptpn11P35235 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Ptpn11P35235 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Ptpn11P35235 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Ptpn11P35235 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,45
Ptpn11P35235 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Ptpn11P35235 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Ptpn11P35235 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Ptpn11P35235 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Ptpn11P35235 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Ptpn11P35235 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Ptpn11P35235 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Ptpn11P35235 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Ptpn11P35235 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,22■■■□□ 2,43
Ptpn11P35235 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Ptpn11P35235 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Ptpn11P35235 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Ptpn11P35235 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Ptpn11P35235 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Ptpn11P35235 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Ptpn11P35235 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ptpn11P35235 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ptpn11P35235 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,11■■■□□ 2,41
Ptpn11P35235 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ptpn11P35235 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Ptpn11P35235 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Ptpn11P35235 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,09■■■□□ 2,41
Ptpn11P35235 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ptpn11P35235 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ptpn11P35235 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ptpn11P35235 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Ptpn11P35235 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ptpn11P35235 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ptpn11P35235 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Ptpn11P35235 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ptpn11P35235 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ptpn11P35235 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ptpn11P35235 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ptpn11P35235 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ptpn11P35235 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ptpn11P35235 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ptpn11P35235 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Ptpn11P35235 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ptpn11P35235 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Ptpn11P35235 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Ptpn11P35235 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Ptpn11P35235 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Ptpn11P35235 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Ptpn11P35235 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Ptpn11P35235 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Ptpn11P35235 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ptpn11P35235 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,64■■■□□ 2,34
Ptpn11P35235 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Ptpn11P35235 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Ptpn11P35235 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Ptpn11P35235 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Ptpn11P35235 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Ptpn11P35235 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Ptpn11P35235 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ptpn11P35235 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ptpn11P35235 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Ptpn11P35235 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ptpn11P35235 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ptpn11P35235 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Ptpn11P35235 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
Ptpn11P35235 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ptpn11P35235 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Ptpn11P35235 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ptpn11P35235 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ptpn11P35235 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ptpn11P35235 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ptpn11P35235 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ptpn11P35235 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Ptpn11P35235 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Ptpn11P35235 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ptpn11P35235 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ptpn11P35235 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ptpn11P35235 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms